Affine Alignment
 
Alignment between CSHL1 (top ENST00000309894.6 222aa) and CSH1 (bottom ENST00000316193.13 217aa) score 19133

001 MAAGSRTSLLLAFALLCLPWLQEAGAVQTVPLSRLFKEAMLQAHRAHQLAIDTYQEFISS 060
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   
001 MAPGSRTSLLLAFALLCLPWLQEAGAVQTVPLSRLFDHAMLQAHRAHQLAIDTYQEF--- 057

061 WGMEAYITKEQKYSFLHDSQTSFCFSDSIPTSSNMEETQQKSNLELLHISLLLIESRLEP 120
       | || |+||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||
058 --EETYIPKDQKYSFLHDSQTSFCFSDSIPTPSNMEETQQKSNLELLRISLLLIESWLEP 115

121 VRFLRSTFTNNLVYDTSDSDDYHLLKDLEEGIQMLMGRLEDGSHLTGQTLKQTYSKFDTN 180
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||
116 VRFLRSMFANNLVYDTSDSDDYHLLKDLEEGIQTLMGRLEDGSRRTGQILKQTYSKFDTN 175

181 SHNHDALLKNYGLLHCFRKDMDKVETFLRMVQCRSVEGSCGF 222
    ||||||||||||||+|||||||||||||||||||||||||||
176 SHNHDALLKNYGLLYCFRKDMDKVETFLRMVQCRSVEGSCGF 217