Affine Alignment
 
Alignment between ZSCAN30 (top ENST00000333206.10 494aa) and ZSCAN30 (bottom ENST00000333206.10 494aa) score 49856

001 MSGEATVLAYHAPEEQEGLLVVKVEEENYVLDQDFGLQENPWSQEVFRQKFRQFSYSDST 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MSGEATVLAYHAPEEQEGLLVVKVEEENYVLDQDFGLQENPWSQEVFRQKFRQFSYSDST 060

061 GPREALSRLRELCCQWLRPEVHSKEQILELLMLEQFLAILPEELQAWLREHRPENGEEAV 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 GPREALSRLRELCCQWLRPEVHSKEQILELLMLEQFLAILPEELQAWLREHRPENGEEAV 120

121 TMLEELEKELEEPRQQDTTHGQEMFWQEMTSTGALKSLSLNSPVQPLENQCKTETQESQA 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 TMLEELEKELEEPRQQDTTHGQEMFWQEMTSTGALKSLSLNSPVQPLENQCKTETQESQA 180

181 FQERDGRMVAGKVLMAKQEIVECVASAAMISPGKLPGETHSQRIAEEALGGLDNSKKQKG 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 FQERDGRMVAGKVLMAKQEIVECVASAAMISPGKLPGETHSQRIAEEALGGLDNSKKQKG 240

241 NAAGNKISQLPSQDRHFSLATFNRRIPTEHSVLESHESEGSFSMNSNDITQQSVDTREKL 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 NAAGNKISQLPSQDRHFSLATFNRRIPTEHSVLESHESEGSFSMNSNDITQQSVDTREKL 300

301 YECFDCGKAFCQSSKLIRHQRIHTGERPYACKECGKAFSLSSDLVRHQRIHSGEKPYECC 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 YECFDCGKAFCQSSKLIRHQRIHTGERPYACKECGKAFSLSSDLVRHQRIHSGEKPYECC 360

361 ECGKAFRGSSELIRHRRIHTGEKPYECGECGKAFSRSSALIQHKKIHTGDKSYECIACGK 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 ECGKAFRGSSELIRHRRIHTGEKPYECGECGKAFSRSSALIQHKKIHTGDKSYECIACGK 420

421 AFGRSSILIEHQRIHTGEKPYECNECGKSFNQSSALTQHQRIHTGEKPYECSECRKTFRH 480
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421 AFGRSSILIEHQRIHTGEKPYECNECGKSFNQSSALTQHQRIHTGEKPYECSECRKTFRH 480

481 RSGLMQHQRTHTRV 494
    ||||||||||||||
481 RSGLMQHQRTHTRV 494