Affine Alignment
 
Alignment between PCDHGA2 (top ENST00000394576.3 932aa) and PCDHGA2 (bottom ENST00000394576.3 932aa) score 90649

001 MAALQKLPHCRKLVLLCFLLATLWEARAGQIRYSVREEIDRGSFVGNIAKDLGLEPLALA 060
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001 MAALQKLPHCRKLVLLCFLLATLWEARAGQIRYSVREEIDRGSFVGNIAKDLGLEPLALA 060

061 EQGVRIVSRGRSQLFALNPRSGSLVTANRIDREELCAQSAPCLLNFNILLEDKLTIYSVE 120
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061 EQGVRIVSRGRSQLFALNPRSGSLVTANRIDREELCAQSAPCLLNFNILLEDKLTIYSVE 120

121 VEITDINDNAPRFGVEELELKISETTTPGFRIPLKNAHDADVGENALQKYALNPNDHFSL 180
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121 VEITDINDNAPRFGVEELELKISETTTPGFRIPLKNAHDADVGENALQKYALNPNDHFSL 180

181 DVRRGADGNKYPELVLERSLDREEEAVHHLVLVASDGGDPVLSGTSRICVKVLDANDNAP 240
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181 DVRRGADGNKYPELVLERSLDREEEAVHHLVLVASDGGDPVLSGTSRICVKVLDANDNAP 240

241 VFTQPEYRISIPENTLVGTRILTVTATDADEGYYAQVVYFLEKSPGETSEVFELKSTSGE 300
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241 VFTQPEYRISIPENTLVGTRILTVTATDADEGYYAQVVYFLEKSPGETSEVFELKSTSGE 300

301 LTIIKDLDYEDATFHEIDIEAQDGPGLLTRAKVIVTVLDVNDNAPEFYMTSATSSVSEDS 360
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301 LTIIKDLDYEDATFHEIDIEAQDGPGLLTRAKVIVTVLDVNDNAPEFYMTSATSSVSEDS 360

361 LPGTIIGLFNVHDRDSGQNAFTTCSLPEDLPFKLEKSVDNYYRLVTTRALDREQFSFYNI 420
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361 LPGTIIGLFNVHDRDSGQNAFTTCSLPEDLPFKLEKSVDNYYRLVTTRALDREQFSFYNI 420

421 TLTAKDGGNPSLSTDAHILLQVADINDNAPAFSRTSYSTYIPENNPRGASVFSVTAHDPD 480
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421 TLTAKDGGNPSLSTDAHILLQVADINDNAPAFSRTSYSTYIPENNPRGASVFSVTAHDPD 480

481 SNDNAHVTYSFAEDTVQGAPLSSYISINSDTGVLYALRSFDYEQLRDLQVWVIARDSGNP 540
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481 SNDNAHVTYSFAEDTVQGAPLSSYISINSDTGVLYALRSFDYEQLRDLQVWVIARDSGNP 540

541 PLSSNVSLSLFVLDQNDNAPEILYPAFPTDGSTGVELAPRSAEPGYLVTKVVAVDRDSGQ 600
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541 PLSSNVSLSLFVLDQNDNAPEILYPAFPTDGSTGVELAPRSAEPGYLVTKVVAVDRDSGQ 600

601 NAWLSYHLLKASEPGLFSVGLHTGEVRTARALLDRDALKQSLVVAIQDHGQPPLSATVTL 660
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601 NAWLSYHLLKASEPGLFSVGLHTGEVRTARALLDRDALKQSLVVAIQDHGQPPLSATVTL 660

661 TVAVADRIPDILADLGSLEPSAIPNDSDLTLYLVVAVAAVSCVFLAFVIVLLAHRLRRWH 720
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661 TVAVADRIPDILADLGSLEPSAIPNDSDLTLYLVVAVAAVSCVFLAFVIVLLAHRLRRWH 720

721 KSRLLQASGGSLTGMQSSHFVGVDGVRAFLQTYSHEVSLTADSRKSHLIFPQPNYADTLI 780
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721 KSRLLQASGGSLTGMQSSHFVGVDGVRAFLQTYSHEVSLTADSRKSHLIFPQPNYADTLI 780

781 SQESCEKKDFLSAPQSLLEEEREETFSQQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPN 840
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781 SQESCEKKDFLSAPQSLLEEEREETFSQQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPN 840

841 NQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPDYRQNVYIPGS 900
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841 NQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPDYRQNVYIPGS 900

901 NATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK 932
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901 NATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK 932