Affine Alignment
 
Alignment between CLOCK (top ENST00000513440.6 846aa) and CLOCK (bottom ENST00000513440.6 846aa) score 82669

001 MLFTVSCSKMSSIVDRDDSSIFDGLVEEDDKDKAKRVSRNKSEKKRRDQFNVLIKELGSM 060
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001 MLFTVSCSKMSSIVDRDDSSIFDGLVEEDDKDKAKRVSRNKSEKKRRDQFNVLIKELGSM 060

061 LPGNARKMDKSTVLQKSIDFLRKHKEITAQSDASEIRQDWKPTFLSNEEFTQLMLEALDG 120
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061 LPGNARKMDKSTVLQKSIDFLRKHKEITAQSDASEIRQDWKPTFLSNEEFTQLMLEALDG 120

121 FFLAIMTDGSIIYVSESVTSLLEHLPSDLVDQSIFNFIPEGEHSEVYKILSTHLLESDSL 180
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121 FFLAIMTDGSIIYVSESVTSLLEHLPSDLVDQSIFNFIPEGEHSEVYKILSTHLLESDSL 180

181 TPEYLKSKNQLEFCCHMLRGTIDPKEPSTYEYVKFIGNFKSLNSVSSSAHNGFEGTIQRT 240
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181 TPEYLKSKNQLEFCCHMLRGTIDPKEPSTYEYVKFIGNFKSLNSVSSSAHNGFEGTIQRT 240

241 HRPSYEDRVCFVATVRLATPQFIKEMCTVEEPNEEFTSRHSLEWKFLFLDHRAPPIIGYL 300
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241 HRPSYEDRVCFVATVRLATPQFIKEMCTVEEPNEEFTSRHSLEWKFLFLDHRAPPIIGYL 300

301 PFEVLGTSGYDYYHVDDLENLAKCHEHLMQYGKGKSCYYRFLTKGQQWIWLQTHYYITYH 360
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301 PFEVLGTSGYDYYHVDDLENLAKCHEHLMQYGKGKSCYYRFLTKGQQWIWLQTHYYITYH 360

361 QWNSRPEFIVCTHTVVSYAEVRAERRRELGIEESLPETAADKSQDSGSDNRINTVSLKEA 420
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361 QWNSRPEFIVCTHTVVSYAEVRAERRRELGIEESLPETAADKSQDSGSDNRINTVSLKEA 420

421 LERFDHSPTPSASSRSSRKSSHTAVSDPSSTPTKIPTDTSTPPRQHLPAHEKMVQRRSSF 480
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421 LERFDHSPTPSASSRSSRKSSHTAVSDPSSTPTKIPTDTSTPPRQHLPAHEKMVQRRSSF 480

481 SSQSINSQSVGSSLTQPVMSQATNLPIPQGMSQFQFSAQLGAMQHLKDQLEQRTRMIEAN 540
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481 SSQSINSQSVGSSLTQPVMSQATNLPIPQGMSQFQFSAQLGAMQHLKDQLEQRTRMIEAN 540

541 IHRQQEELRKIQEQLQMVHGQGLQMFLQQSNPGLNFGSVQLSSGNSSNIQQLAPINMQGQ 600
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601 VVPTNQIQSGMNTGHIGTTQHMIQQQTLQSTSTQSQQNVLSGHSQQTSLPSQTQSTLTAP 660
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601 VVPTNQIQSGMNTGHIGTTQHMIQQQTLQSTSTQSQQNVLSGHSQQTSLPSQTQSTLTAP 660

661 LYNTMVISQPAAGSMVQIPSSMPQNSTQSAAVTTFTQDRQIRFSQGQQLVTKLVTAPVAC 720
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661 LYNTMVISQPAAGSMVQIPSSMPQNSTQSAAVTTFTQDRQIRFSQGQQLVTKLVTAPVAC 720

721 GAVMVPSTMLMGQVVTAYPTFATQQQQSQTLSVTQQQQQQSSQEQQLTSVQQPSQAQLTQ 780
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721 GAVMVPSTMLMGQVVTAYPTFATQQQQSQTLSVTQQQQQQSSQEQQLTSVQQPSQAQLTQ 780

781 PPQQFLQTSRLLHGNPSTQLILSAAFPLQQSTFPQSHHQQHQSQQQQQLSRHRTDSLPDP 840
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781 PPQQFLQTSRLLHGNPSTQLILSAAFPLQQSTFPQSHHQQHQSQQQQQLSRHRTDSLPDP 840

841 SKVQPQ 846
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841 SKVQPQ 846