UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1IGHV3-16n/a
    
    
     
4e-64chr14 106,165,467Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of immunoglobulin heavy chains  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive immunoglobulin chain due to altered V-  (D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A0C4DH30)
2GZMAP1n/a
    
    
     
n/achr5 55,084,784granzyme A pseudogene 1 (from HGNC GZMAP1)
3SNX18P25n/a
    
    
     
n/achr4 49,589,150sorting nexin 18 pseudogene 25 (from HGNC SNX18P25)
4IGHV3-35n/a
    
    
     
4e-58chr14 106,389,625Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of immunoglobulin heavy chains  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive immunoglobulin chain due to altered V-  (D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A0C4DH35)
5OLA1P2n/a
    
    
     
n/achr17 20,776,273Obg-like ATPase 1 pseudogene 2 (from HGNC OLA1P2)
6GPX1P2n/a
    
    
     
n/achr21 27,143,646glutathione peroxidase pseudogene 2 (from HGNC GPX1P2)
7RN7SL825Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 31,992,234RNA, 7SL, cytoplasmic 825, pseudogene (from HGNC RN7SL825P)
8TRBV21OR9-2n/a
    
    
     
n/achr9 33,629,353T cell receptor beta variable 21/OR9-2 (pseudogene) (from HGNC TRBV21OR9-2)
9RN7SKP10n/a
    
    
     
n/achr13 109,915,258RNA, 7SK small nuclear pseudogene 10 (from HGNC RN7SKP10)
10OR4F7Pn/a
    
    
     
n/achr6 170,640,071olfactory receptor family 4 subfamily F member 7 pseudogene (from HGNC OR4F7P)
11RN7SKP205n/a
    
    
     
n/achr14 23,792,083RNA, 7SK small nuclear pseudogene 205 (from HGNC RN7SKP205)
12H2BL1Pn/a
    
    
     
n/achr5 72,734,021H2BL1P (from geneSymbol)
13DPPA2P2n/a
    
    
     
n/achr1 26,519,802developmental pluripotency associated 2 pseudogene 2 (from HGNC DPPA2P2)
14SSX15Pn/a
    
    
     
n/achrX 52,674,884SSX15P (from geneSymbol)
15TRIM53APn/a
    
    
     
n/achr11 89,996,638tripartite motif containing 53A, pseudogene (from RefSeq NR_028346.1)
16NME2P3n/a
    
    
     
n/achr9 98,891,263NME2P3 (from geneSymbol)
17OR51A10Pn/a
    
    
     
n/achr11 5,468,954olfactory receptor family 51 subfamily A member 10 pseudogene (from HGNC OR51A10P)
18CALM1P2n/a
    
    
     
n/achr7 55,260,032calmodulin 1 pseudogene 2 (from HGNC CALM1P2)
19ENSG00000233352n/a
    
    
     
n/achr20 45,230,004ENSG00000233352 (from geneSymbol)
20RCC2P3n/a
    
    
     
n/achr7 138,123,398regulator of chromosome condensation 2 pseudogene 3 (from HGNC RCC2P3)
21ENSG00000234406n/a
    
    
     
n/achr7 25,187,173ENSG00000234406 (from geneSymbol)
22S100A11P2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 35,169,379S100 calcium binding protein A11 pseudogene 2 (from HGNC S100A11P2)
23ENSG00000236634n/a
    
    
     
n/achr2 204,471,956ENSG00000236634 (from geneSymbol)
24OR2P1Pn/a
    
    
     
n/achr6 29,072,211olfactory receptor family 2 subfamily P member 1 pseudogene (from HGNC OR2P1P)
25S100A11P1n/a
    
    
     
n/achr7 103,262,155S100 calcium binding protein A11 pseudogene 1 (from HGNC S100A11P1)
26RPL17P20n/a
    
    
     
n/achr4 56,710,337ribosomal protein L17 pseudogene 20 (from HGNC RPL17P20)
27ENSG00000242163n/a
    
    
     
n/achr14 81,333,161ENSG00000242163 (from geneSymbol)
28PRR23D2n/a
    
    
     
n/achr8 7,780,002proline rich 23 domain containing 2 (from RefSeq NM_001282478.1)
29ENSG00000256814n/a
    
    
     
n/achr12 125,150,726ENSG00000256814 (from geneSymbol)
30FGFR3P5n/a
    
    
     
n/achr16 35,234,198fibroblast growth factor receptor 3 pseudogene 5 (from HGNC FGFR3P5)
31OR1X1Pn/a
    
    
     
n/achr5 176,006,766olfactory receptor family 1 subfamily X member 1 pseudogene (from HGNC OR1X1P)
32OR10A7n/a
    
    
     
n/achr12 55,221,500olfactory receptor family 10 subfamily A member 7 (from RefSeq NM_001005280.1)
33KRTAP10-12n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 44,697,608keratin associated protein 10-12 (from RefSeq NM_198699.1)
34ARPC1BP1n/a
    
    
     
n/achr2 208,361,000ARPC1BP1 (from geneSymbol)
35LL22NC01-81G9.3n/a
    
    
     
n/achr22 36,966,710uncharacterized protein FLJ39582-like (from RefSeq NR_038954.1)
36RPL12P23n/a
    
    
     
n/achr6 170,200,013ribosomal protein L12 pseudogene 23 (from HGNC RPL12P23)
37ENSG00000224099n/a
    
    
     
n/achr2 195,463,728ENSG00000224099 (from geneSymbol)
38ENSG00000227842n/a
    
    
     
n/achr2 111,717,672ENSG00000227842 (from geneSymbol)
39ENSG00000228982n/a
    
    
     
n/achr1 247,085,728ENSG00000228982 (from geneSymbol)
40VDAC1P13n/a
    
    
     
n/achr2 42,463,568voltage dependent anion channel 1 pseudogene 13 (from HGNC VDAC1P13)
41SLC25A6P3n/a
    
    
     
n/achr1 51,709,501solute carrier family 25 member 6 pseudogene 3 (from HGNC SLC25A6P3)
42OR7E46Pn/a
    
    
     
n/achr2 71,038,194olfactory receptor family 7 subfamily E member 46 pseudogene (from HGNC OR7E46P)
43RPSAP34n/a
    
    
     
n/achr4 108,408,210ribosomal protein SA pseudogene 34 (from HGNC RPSAP34)
44KLF3P2n/a
    
    
     
n/achr3 156,977,691Kruppel like factor 3 pseudogene 2 (from HGNC KLF3P2)
45LINC02075n/a
    
    
     
n/achr17 49,459,805long intergenic non-protein coding RNA 2075 (from RefSeq NR_110805.1)
46MRPL22P1n/a
    
    
     
n/achr4 56,321,026mitochondrial ribosomal protein L22 pseudogene 1 (from HGNC MRPL22P1)
47ENSG00000250398n/a
    
    
     
n/achr4 155,383,604ENSG00000250398 (from geneSymbol)
48ENSG00000253273n/a
    
    
     
n/achr8 73,831,545ENSG00000253273 (from geneSymbol)
49ENSG00000255456n/a
    
    
     
n/achr8 144,585,264ENSG00000255456 (from geneSymbol)
50ENSG00000258753n/a
    
    
     
n/achr14 54,470,963ENSG00000258753 (from geneSymbol)