UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1IGHV3-35n/a
    
    
     
1e-64chr14 106,389,625Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of immunoglobulin heavy chains  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive immunoglobulin chain due to altered V-  (D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A0C4DH35)
2IGHV3-16n/a
    
    
     
4e-58chr14 106,165,467Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of immunoglobulin heavy chains  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive immunoglobulin chain due to altered V-  (D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A0C4DH30)
3ENSG00000255491n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 124,829,669ENSG00000255491 (from geneSymbol)
4SNX18P25n/a
    
    
     
n/achr4 49,589,150sorting nexin 18 pseudogene 25 (from HGNC SNX18P25)
5GZMAP1n/a
    
    
     
n/achr5 55,084,784granzyme A pseudogene 1 (from HGNC GZMAP1)
6RN7SL411Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 40,209,154RNA, 7SL, cytoplasmic 411, pseudogene (from HGNC RN7SL411P)
7IGHV1-67n/a
    
    
     
n/achr14 106,680,822immunoglobulin heavy variable 1-67 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-67)
8LGALS9DPn/a
    
    
     
n/achr17 27,750,543galectin 9D, pseudogene (from HGNC LGALS9DP)
9RN7SL825Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 31,992,234RNA, 7SL, cytoplasmic 825, pseudogene (from HGNC RN7SL825P)
10ENSG00000276636n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22_KI270879v1_alt 262,993ENSG00000276636 (from geneSymbol)
11OR9G4n/a
    
    
     
n/achr11 56,744,960olfactory receptor family 9 subfamily G member 4, transcript variant 2 (from RefSeq NM_001390832.1)
12RPS20P32n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 27,017,731ribosomal protein S20 pseudogene 32 (from HGNC RPS20P32)
13PPIAP60n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 11,351,872peptidylprolyl isomerase A pseudogene 60 (from HGNC PPIAP60)
14RNU6-226Pn/a
    
    
     
n/achr5 175,703,951RNA, U6 small nuclear 226, pseudogene (from HGNC RNU6-226P)
15NUTF2P7n/a
    
    
     
n/achrX 71,016,718nuclear transport factor 2 pseudogene 7 (from HGNC NUTF2P7)
16ENSG00000213076n/a
    
    
     
n/achr6 158,921,710ENSG00000213076 (from geneSymbol)
17ENSG00000213226n/a
    
    
     
n/achr1 147,319,667ENSG00000213226 (from geneSymbol)
18RPL29P29n/a
    
    
     
n/achr13 88,236,758ribosomal protein L29 pseudogene 29 (from HGNC RPL29P29)
19UBE2V1P3n/a
    
    
     
n/achrY 3,866,514ubiquitin conjugating enzyme E2 V1 pseudogene 3 (from HGNC UBE2V1P3)
20ENSG00000230172n/a
    
    
     
n/achr3 14,766,196ENSG00000230172 (from geneSymbol)
21CSN1S2APn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 70,070,148casein alpha s2-like A, pseudogene (from HGNC CSN1S2AP)
22CCSER2P1n/a
    
    
     
n/achr9 102,516,756CCSER2P1 (from geneSymbol)
23RPL21P6n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 55,413,807ribosomal protein L21 pseudogene 6 (from HGNC RPL21P6)
24FLYWCH1P1n/a
    
    
     
n/achr3 180,828,913FLYWCH-type zinc finger 1 pseudogene 1 (from HGNC FLYWCH1P1)
25ENSG00000248317n/a
    
    
     
n/achr4 54,950,729ENSG00000248317 (from geneSymbol)
26SF3A2P1n/a
    
    
     
n/achr3 126,672,664SF3A2P1 (from geneSymbol)
27ENSG00000249259n/a
    
    
     
n/achr4 116,096,088ENSG00000249259 (from geneSymbol)
28KRT18P20n/a
    
    
     
n/achr12 104,977,388keratin 18 pseudogene 20 (from HGNC KRT18P20)
29DNAJC8P1n/a
    
    
     
n/achr14 35,430,445DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C8 pseudogene 1 (from HGNC DNAJC8P1)
30ENSG00000261153n/a
    
    
     
n/achr16 33,809,772ENSG00000261153 (from geneSymbol)
31LINC01924n/a
    
    
     
n/achr18 64,263,846long intergenic non-protein coding RNA 1924 (from RefSeq NR_033881.1)
32SRSF10P1n/a
    
    
     
n/achr18 51,158,832serine and arginine rich splicing factor 10 pseudogene 1 (from HGNC SRSF10P1)
33CSN1S2APn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 70,079,658casein alpha s2-like A, pseudogene (from HGNC CSN1S2AP)
34DEFB118n/a
    
    
     
n/achr20 31,371,262defensin beta 118 (from RefSeq NM_054112.3)
35CROCCP5n/a
    
    
     
n/achr1 21,435,938ciliary rootlet coiled-coil, rootletin pseudogene 5 (from HGNC CROCCP5)
36OR2B3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 29,086,760olfactory receptor family 2 subfamily B member 3 (from RefSeq NM_001005226.2)
37GOLGA6L11Pn/a
    
    
     
n/achrY 24,171,340golgin A6 family-like 11, pseudogene (from HGNC GOLGA6L11P)
38PCNPP2n/a
    
    
     
n/achr9 88,971,114PEST containing nuclear protein pseudogene 2 (from HGNC PCNPP2)
39RAC1P6n/a
    
    
     
n/achr7 115,136,847Rac family small GTPase 1 pseudogene 6 (from HGNC RAC1P6)
40ENSG00000228368n/a
    
    
     
n/achr7 116,966,659ENSG00000228368 (from geneSymbol)
41CBX3P6n/a
    
    
     
n/achr2 154,940,804chromobox 3 pseudogene 6 (from HGNC CBX3P6)
42ENSG00000232174n/a
    
    
     
n/achr5 138,620,646ENSG00000232174 (from geneSymbol)
43ENSG00000232436n/a
    
    
     
n/achr1 221,509,769ENSG00000232436 (from geneSymbol)
44ENSG00000232693n/a
    
    
     
n/achr2 65,377,192ENSG00000232693 (from geneSymbol)
45IGKV1OR2-1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 91,818,009immunoglobulin kappa variable 1/OR2-1 (pseudogene) (from HGNC IGKV1OR2-1)
46UBE2V1P6n/a
    
    
     
n/achr2 169,115,437ubiquitin conjugating enzyme E2 V1 pseudogene 6 (from HGNC UBE2V1P6)
47RPL21P33n/a
    
    
     
n/achr2 60,852,501ribosomal protein L21 pseudogene 33 (from HGNC RPL21P33)
48OR2L9Pn/a
    
    
     
n/achr1 247,975,197olfactory receptor family 2 subfamily L member 9 pseudogene (from HGNC OR2L9P)
49RPL30P4n/a
    
    
     
n/achr3 32,635,388ribosomal protein L30 pseudogene 4 (from HGNC RPL30P4)
50RPS23P7n/a
    
    
     
n/achr17 62,397,769ribosomal protein S23 pseudogene 7 (from HGNC RPS23P7)