UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ENSG00000214797n/a
    
    
     
n/achr11 59,276,454ENSG00000214797 (from geneSymbol)
2SLC25A47P1n/a
    
    
     
n/achr11 59,263,595solute carrier family 25 member 47 pseudogene 1 (from HGNC SLC25A47P1)
3HTN1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 70,054,643histatin 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_002159.4)
4AMTNn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 70,525,656amelotin, transcript variant 1 (from RefSeq NM_212557.4)
5MAF1P1n/a
    
    
     
n/achr3 133,491,164MAF1P1 (from geneSymbol)
6ENSG00000258760n/a
    
    
     
n/achr14 65,269,580ENSG00000258760 (from geneSymbol)
7BPIFB6n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 33,037,847BPI fold containing family B member 6 (from RefSeq NM_174897.2)
8TPM3P8n/a
    
    
     
n/achr2 230,573,488tropomyosin 3 pseudogene 8 (from HGNC TPM3P8)
9RNA5SP69n/a
    
    
     
n/achr1 178,560,971RNA, 5S ribosomal pseudogene 69 (from HGNC RNA5SP69)
10KIRREL3-AS1n/a
    
    
     
n/achr11 126,577,447KIRREL3 antisense RNA 1 (from HGNC KIRREL3-AS1)
11GLYATL1Bn/a
    
    
     
n/achr11 59,090,546glycine-N-acyltransferase like 1B (from RefSeq NM_001355566.1)
12TRGV1n/a
    
    
     
n/achr7 38,367,877Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma chain  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive T cell receptor (TR) chain due to altered  V-(D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0A0MS02)
13RNU2-6Pn/a
    
    
     
n/achr13 46,374,495RNA, U2 small nuclear 6, pseudogene (from HGNC RNU2-6P)
14VTRNA1-3n/a
    
    
     
n/achr5 140,726,202vault RNA 1-3 (from RefSeq NR_026705.1)
15RN7SL337Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 14,584,245RNA, 7SL, cytoplasmic 337, pseudogene (from HGNC RN7SL337P)
16BNIP3P4n/a
    
    
     
n/achr9 64,811,147BCL2 interacting protein 3 pseudogene 4 (from HGNC BNIP3P4)
17ENSG00000236800n/a
    
    
     
n/achr10 48,668,311ENSG00000236800 (from geneSymbol)
18IGHEP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 105,722,160immunoglobulin heavy constant epsilon P1 (pseudogene) (from HGNC IGHEP1)
19UBE2V2P1n/a
    
    
     
n/achr10 19,051,812ubiquitin conjugating enzyme E2 V2 pseudogene 1 (from HGNC UBE2V2P1)
20RNU6-216Pn/a
    
    
     
n/achr11 74,968,240RNA, U6 small nuclear 216, pseudogene (from HGNC RNU6-216P)
21IGKV1D-37n/a
    
    
     
n/achr2 89,884,978Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of immunoglobulin light chains  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive immunoglobulin chain due to altered V-  (D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt P0DSN7)
22RNA5SP323n/a
    
    
     
n/achr10 93,510,614RNA, 5S ribosomal pseudogene 323 (from HGNC RNA5SP323)
23ENSG00000279846n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 99,498,093ENSG00000279846 (from geneSymbol)
24LINC00974n/a
    
    
     
n/achr17 41,552,050long intergenic non-protein coding RNA 974 (from RefSeq NR_038442.1)
25SSBL4Pn/a
    
    
     
n/achr1 147,082,958SSBL4P (from geneSymbol)
26ENSG00000248571n/a
    
    
     
n/achr4 152,668,237ENSG00000248571 (from geneSymbol)
27UGT2B29Pn/a
    
    
     
n/achr4 68,513,544UDP glucuronosyltransferase family 2 member B29, pseudogene (from HGNC UGT2B29P)
28IGLC4n/a
    
    
     
n/achr22 22,910,951immunoglobulin lambda constant 4 (pseudogene) (from HGNC IGLC4)
29ENSG00000227055n/a
    
    
     
n/achr2 159,813,121ENSG00000227055 (from geneSymbol)
30ENSG00000251922n/a
    
    
     
n/achr10 6,017,124ENSG00000251922 (from geneSymbol)
31ADAM7-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 24,606,479ADAM7-AS1 (from geneSymbol)
32ENSG00000256988n/a
    
    
     
n/achr12 4,817,638ENSG00000256988 (from geneSymbol)
33ENSG00000258878n/a
    
    
     
n/achr14 65,234,808ENSG00000258878 (from geneSymbol)
34LINC02909n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 25,000,733LINC02909 (from geneSymbol)
35ENSG00000262703n/a
    
    
     
n/achr16 11,348,732ENSG00000262703 (from geneSymbol)
36SIDT1-AS1n/a
    
    
     
n/achr3 113,589,468SIDT1 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_046729.1)
37LINC02642n/a
    
    
     
n/achr10 7,458,100long intergenic non-protein coding RNA 2642, transcript variant 12 (from RefSeq NR_184124.1)
38ENSG00000233290n/a
    
    
     
n/achr1 82,530,309ENSG00000233290 (from geneSymbol)
39SNORD13n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 33,513,526small nucleolar RNA, C/D box 13 (from RefSeq NR_003041.1)
40ATP5MC2P3n/a
    
    
     
n/achr2 197,263,323ATP synthase membrane subunit c locus 2 pseudogene 3 (from HGNC ATP5MC2P3)
41MIR589n/a
    
    
     
n/achr7 5,495,868microRNA 589 (from RefSeq NR_030318.1)
42LINC03089n/a
    
    
     
n/achr10 44,260,707LINC03089 (from geneSymbol)
43TIFABn/a
    
    
     
n/achr5 135,448,288TIFA inhibitor (from RefSeq NM_001099221.2)
44LINC02463n/a
    
    
     
n/achr12 115,848,248long intergenic non-protein coding RNA 2463 (from HGNC LINC02463)
45BNIP3P43n/a
    
    
     
n/achr21 13,120,525BNIP3P43 (from geneSymbol)
46ENSG00000268289n/a
    
    
     
n/achr19 17,053,540ENSG00000268289 (from geneSymbol)
47EIF5AP2n/a
    
    
     
n/achr17 78,158,269eukaryotic translation initiation factor 5A pseudogene 2 (from HGNC EIF5AP2)
48RPSAP50n/a
    
    
     
n/achr11 109,982,617ribosomal protein SA pseudogene 50 (from HGNC RPSAP50)
49OR2T3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 248,473,829olfactory receptor family 2 subfamily T member 3 (from RefSeq NM_001005495.1)
50ENSG00000236941n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 164,948,758ENSG00000236941 (from geneSymbol)