UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZC3H12Dn/a
n/a
n/a
n/a
0chr6 149,465,904zinc finger CCCH-type containing 12D (from RefSeq NM_207360.3)
2TMEM156n/a
    
    
     
n/achr4 38,999,576transmembrane protein 156, transcript variant 1 (from RefSeq NM_024943.3)
3CXCR3n/a
    
    
     
n/achrX 71,617,215C-X-C motif chemokine receptor 3, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001504.2)
4ENSG00000268027n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 41,550,221ENSG00000268027 (from geneSymbol)
5LINC02397n/a
    
    
     
n/achr12 92,479,271long intergenic non-protein coding RNA 2397 (from HGNC LINC02397)
6CLLU1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 92,426,259chronic lymphocytic leukemia up-regulated 1, transcript variant 2 (from RefSeq NR_027932.1)
7ENSG00000266923n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 92,452,605ENSG00000266923 (from geneSymbol)
8ADGRG5n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 57,559,916adhesion G protein-coupled receptor G5, transcript variant 3 (from RefSeq NM_001318481.2)
9ENSG00000233665n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 48,984,800ENSG00000233665 (from geneSymbol)
10LINC00426n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 30,358,630long intergenic non-protein coding RNA 426 (from HGNC LINC00426)
11CARD11-AS1n/a
    
    
     
n/achr7 2,945,563CARD11 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_187443.1)
12LAX1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 203,770,777lymphocyte transmembrane adaptor 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_017773.4)
13IGHV5-78n/a
    
    
     
n/achr14 106,851,270immunoglobulin heavy variable 5-78 (pseudogene) (from HGNC IGHV5-78)
14GVINP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 6,718,245GTPase, very large interferon inducible pseudogene 1 (from RefSeq NR_003945.1)
15IL12RB1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 18,072,964interleukin 12 receptor subunit beta 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_005535.3)
16LY9n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 160,812,214lymphocyte antigen 9, transcript variant 1 (from RefSeq NM_002348.4)
17PDCD1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 241,854,389programmed cell death 1 (from RefSeq NM_005018.3)
18CENPKn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 65,540,467centromere protein K, transcript variant 1 (from RefSeq NM_022145.5)
19KIF4An/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 70,355,495kinesin family member 4A (from RefSeq NM_012310.5)
20ENSG00000272825n/a
    
    
     
n/achr21 44,936,628ENSG00000272825 (from geneSymbol)
21ENSG00000269954n/a
    
    
     
n/achr8 11,558,591ENSG00000269954 (from geneSymbol)
22ENSG00000267074n/a
    
    
     
n/achr17 35,504,980ENSG00000267074 (from geneSymbol)
23PDE6Gn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 81,653,500phosphodiesterase 6G, transcript variant 1 (from RefSeq NM_002602.4)
24ENSG00000253690n/a
    
    
     
n/achr8 28,294,659ENSG00000253690 (from geneSymbol)
25GPR55n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 230,916,285G protein-coupled receptor 55 (from RefSeq NM_005683.4)
26PRR11-AS1n/a
    
    
     
n/achr17 59,203,253PRR11-AS1 (from geneSymbol)
27SPC25n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 168,880,660SPC25 component of NDC80 kinetochore complex (from RefSeq NM_020675.4)
28ENSG00000267554n/a
    
    
     
n/achr17 35,470,348ENSG00000267554 (from geneSymbol)
29GINS4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 41,537,145GINS complex subunit 4 (from RefSeq NM_032336.3)
30TRGV4n/a
    
    
     
n/achr7 38,354,116V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0C4DH28)
31ENSG00000237604n/a
    
    
     
n/achr21 44,175,971ENSG00000237604 (from geneSymbol)
32TRGV3n/a
    
    
     
n/achr7 38,358,837V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt P03979)
33CYLD-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 50,735,116CYLD antisense RNA 1, transcript variant 7 (from RefSeq NR_184279.1)
34MTFR2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 136,240,672mitochondrial fission regulator 2, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001099286.3)
35KCNA3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 110,673,702potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, transcript variant 1 (from RefSeq NM_002232.5)
36ENSG00000271680n/a
    
    
     
n/achr1 206,906,160ENSG00000271680 (from geneSymbol)
37ENSG00000286030n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 35,522,624ENSG00000286030 (from geneSymbol)
38NAP1L4P1n/a
    
    
     
n/achr1 116,533,514nucleosome assembly protein 1 like 4 pseudogene 1 (from HGNC NAP1L4P1)
39TIGITn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 114,302,158T cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains (from RefSeq NM_173799.4)
40CD200R1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 112,948,154CD200 receptor 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_138806.4)
41ENSG00000260997n/a
    
    
     
n/achr7 44,959,954ENSG00000260997 (from geneSymbol)
42SNORD17n/a
    
    
     
n/achr20 17,962,828small nucleolar RNA, C/D box 17 (from RefSeq NR_003045.1)
43ENSG00000187951n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 30,715,855OTU deubiquitinase 7A pseudogene, transcript variant 3 (from RefSeq NR_038255.1)
44ENSG00000290886n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 30,684,813ENSG00000290886 (from geneSymbol)
45CCL3L3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17_KI270909v1_alt 251,521C-C motif chemokine ligand 3 like 1, transcript variant 2 (from RefSeq NR_111964.2)
46CNR2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 23,891,938cannabinoid receptor 2 (from RefSeq NM_001841.3)
47CTLA4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 203,870,868cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4, transcript variant 1 (from RefSeq NM_005214.5)
48UBASH3An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 42,425,793ubiquitin associated and SH3 domain containing A, transcript variant 1 (from RefSeq NM_018961.4)
49TOMM20P2n/a
    
    
     
n/achr17 35,514,976TOMM20 pseudogene 2 (from HGNC TOMM20P2)
50ADGRE4Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 6,972,728adhesion G protein-coupled receptor E4, pseudogene (from HGNC ADGRE4P)