UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ENSG00000226535n/a
    
    
     
n/achr9 107,170,358ENSG00000226535 (from geneSymbol)
2ENSG00000230121n/a
    
    
     
n/achr10 7,534,886uncharacterized LOC105376390 (from RefSeq NR_188188.1)
3PMM2P2n/a
    
    
     
n/achr18 12,192,568phosphomannomutase 2 pseudogene 2 (from HGNC PMM2P2)
4TRBV6-7n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 471,654Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of T cell receptor (TR) beta chain  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive T cell receptor (TR) chain due to altered  V-(D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0A0MS04)
5HMGB1P45n/a
    
    
     
n/achr1 50,399,299high mobility group box 1 pseudogene 45 (from HGNC HMGB1P45)
6RPS21P2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 106,288,928ribosomal protein S21 pseudogene 2 (from HGNC RPS21P2)
7TXNP1n/a
    
    
     
n/achr10 119,683,475thioredoxin pseudogene 1 (from HGNC TXNP1)
8RN7SL352Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 1,507,460RNA, 7SL, cytoplasmic 352, pseudogene (from HGNC RN7SL352P)
9PDE2A-AS1n/a
    
    
     
n/achr11 72,651,322PDE2A-AS1 (from geneSymbol)
10BUB1B-PAK6n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 40,241,695BUB1B-PAK6 readthrough (from HGNC BUB1B-PAK6)
11OR2F1n/a
    
    
     
n/achr7 143,959,602olfactory receptor family 2 subfamily F member 1 (from RefSeq NM_012369.3)
12SLC25A5P6n/a
    
    
     
n/achr4 186,329,158solute carrier family 25 member 5 pseudogene 6 (from HGNC SLC25A5P6)
13KRT18P42n/a
    
    
     
n/achr5 109,588,965keratin 18 pseudogene 42 (from HGNC KRT18P42)
14CYCSP55n/a
    
    
     
n/achr6 34,219,752cytochrome c, somatic pseudogene 55 (from HGNC CYCSP55)
15MIR1302-9HGn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 29,274MIR1302-9HG (from geneSymbol)
16LINC02216n/a
    
    
     
n/achr5 118,578,449long intergenic non-protein coding RNA 2216 (from RefSeq NR_183313.1)
17SEPHS2P1n/a
    
    
     
n/achr5 14,960,812selenophosphate synthetase 2 pseudogene 1 (from HGNC SEPHS2P1)
18ENSG00000259395n/a
    
    
     
n/achr15 36,342,952ENSG00000259395 (from geneSymbol)
19TP53TG3GPn/a
    
    
     
n/achr16 35,208,069TP53 target 3 family member G, pseudogene (from HGNC TP53TG3GP)
20ENSG00000261347n/a
    
    
     
n/achr11 69,468,651ENSG00000261347 (from geneSymbol)
21ENSG00000266105n/a
    
    
     
n/achr18 31,967,252ENSG00000266105 (from geneSymbol)
22ENSG00000219240n/a
    
    
     
n/achr6 89,887,002ENSG00000219240 (from geneSymbol)
23ENSG00000228627n/a
    
    
     
n/achr7 53,569,361uncharacterized GS1-278J22.2 (from RefSeq NR_187904.1)
24RPL17P46n/a
    
    
     
n/achr18 50,823,848ribosomal protein L17 pseudogene 46 (from HGNC RPL17P46)
25NDUFB2P1n/a
    
    
     
n/achr4 154,724,733NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B2 pseudogene 2 (from HGNC NDUFB2P1)
26ANO3-AS1n/a
    
    
     
n/achr11 26,308,433ANO3-AS1 (from geneSymbol)
27DDX11L8n/a
    
    
     
n/achr12 12,905DEAD/H-box helicase 11 like 8 (from HGNC DDX11L8)
28ENSG00000260393n/a
    
    
     
n/achr16 52,607,960ENSG00000260393 (from geneSymbol)
29LINC02252n/a
    
    
     
n/achr15 34,661,115long intergenic non-protein coding RNA 2252 (from RefSeq NR_146869.1)
30LINC01520n/a
    
    
     
n/achr10 85,470,794long intergenic non-protein coding RNA 1520 (from RefSeq NR_120671.1)
31PMPCAP1n/a
    
    
     
n/achr4 92,183,264peptidase, mitochondrial processing alpha subunit pseudogene 1 (from HGNC PMPCAP1)
32OR7E21Pn/a
    
    
     
n/achr3 130,035,046olfactory receptor family 7 subfamily E member 21 pseudogene (from HGNC OR7E21P)
33ENSG00000255977n/a
    
    
     
n/achr12 7,607,082ENSG00000255977 (from geneSymbol)
34ANP32BP3n/a
    
    
     
n/achr15 81,117,987acidic nuclear phosphoprotein 32 family member B pseudogene 3 (from HGNC ANP32BP3)
35DNM1P28n/a
    
    
     
n/achr15 30,100,459dynamin 1 pseudogene 28 (from HGNC DNM1P28)
36SAA3Pn/a
    
    
     
n/achr11 18,114,352serum amyloid A3, pseudogene (from HGNC SAA3P)
37ARGFXn/a
    
    
     
n/achr3 121,579,285arginine-fifty homeobox (from RefSeq NM_001012659.2)
38DDX11L1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 12,840DEAD/H-box helicase 11 like 1 (from HGNC DDX11L1)
39HDAC9-AS1n/a
    
    
     
n/achr7 18,895,764HDAC9-AS1 (from geneSymbol)
40ENSG00000229846n/a
    
    
     
n/achr1 49,106,590ENSG00000229846 (from geneSymbol)
41SLC9B1P3n/a
    
    
     
n/achr10 38,665,019solute carrier family 9 member B1 pseudogene 3 (from HGNC SLC9B1P3)
42RPL21P96n/a
    
    
     
n/achr11 103,045,474ribosomal protein L21 pseudogene 96 (from HGNC RPL21P96)
43UBE2Q2P9n/a
    
    
     
n/achr3 72,006,874ubiquitin conjugating enzyme E2 Q2 pseudogene 9 (from HGNC UBE2Q2P9)
44PPIAP49n/a
    
    
     
n/achr16 74,221,178peptidylprolyl isomerase A pseudogene 49 (from HGNC PPIAP49)
45SSX4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 48,388,443SSX family member 4, transcript variant 1 (from RefSeq NM_005636.4)
46SAA3Pn/a
    
    
     
n/achr11 18,114,302serum amyloid A3, pseudogene (from RefSeq NR_026576.2)
47OR2AD1Pn/a
    
    
     
n/achr6 29,027,143olfactory receptor family 2 subfamily AD member 1 pseudogene (from HGNC OR2AD1P)
48ENSG00000224012n/a
    
    
     
n/achr5 163,709,362ENSG00000224012 (from geneSymbol)
49FGF12-AS1n/a
    
    
     
n/achr3 192,260,863FGF12 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_046596.1)
50LARGE-IT1n/a
    
    
     
n/achr22 33,724,372LARGE intronic transcript 1 (from HGNC LARGE-IT1)