UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1CARD11-AS1n/a
    
    
     
n/achr7 2,945,563CARD11 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_187443.1)
2IGHV5-78n/a
    
    
     
n/achr14 106,851,270immunoglobulin heavy variable 5-78 (pseudogene) (from HGNC IGHV5-78)
3LINC00426n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 30,358,630long intergenic non-protein coding RNA 426 (from HGNC LINC00426)
4PDE6Gn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 81,653,500phosphodiesterase 6G, transcript variant 1 (from RefSeq NM_002602.4)
5ENSG00000233665n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 48,984,800ENSG00000233665 (from geneSymbol)
6GPR55n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 230,916,285G protein-coupled receptor 55 (from RefSeq NM_005683.4)
7LINC02397n/a
    
    
     
n/achr12 92,479,271long intergenic non-protein coding RNA 2397 (from HGNC LINC02397)
8CLLU1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 92,426,259chronic lymphocytic leukemia up-regulated 1, transcript variant 2 (from RefSeq NR_027932.1)
9ENSG00000266923n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 92,452,605ENSG00000266923 (from geneSymbol)
10ADGRG5n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 57,559,916adhesion G protein-coupled receptor G5, transcript variant 3 (from RefSeq NM_001318481.2)
11ZC3H12Dn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 149,465,904zinc finger CCCH-type containing 12D (from RefSeq NM_207360.3)
12CXCR3n/a
    
    
     
n/achrX 71,617,215C-X-C motif chemokine receptor 3, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001504.2)
13ENSG00000269050n/a
    
    
     
n/achr19 38,871,961ENSG00000269050 (from geneSymbol)
14SPC25n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 168,880,660SPC25 component of NDC80 kinetochore complex (from RefSeq NM_020675.4)
15EXO1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 241,869,071exonuclease 1, transcript variant 2 (from RefSeq NM_130398.4)
16ESCO2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 27,789,935establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 2 (from RefSeq NM_001017420.3)
17TMEM156n/a
    
    
     
n/achr4 38,999,576transmembrane protein 156, transcript variant 1 (from RefSeq NM_024943.3)
18TIGITn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 114,302,158T cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains (from RefSeq NM_173799.4)
19TRGV4n/a
    
    
     
n/achr7 38,354,116V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0C4DH28)
20ENSG00000267074n/a
    
    
     
n/achr17 35,504,980ENSG00000267074 (from geneSymbol)
21LAX1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 203,770,777lymphocyte transmembrane adaptor 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_017773.4)
22TRGV3n/a
    
    
     
n/achr7 38,358,837V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt P03979)
23E2F7n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 77,043,410E2F transcription factor 7 (from RefSeq NM_203394.3)
24CCL3L3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17_KI270909v1_alt 251,521C-C motif chemokine ligand 3 like 1, transcript variant 2 (from RefSeq NR_111964.2)
25CYLD-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 50,735,116CYLD antisense RNA 1, transcript variant 7 (from RefSeq NR_184279.1)
26UBASH3An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 42,425,793ubiquitin associated and SH3 domain containing A, transcript variant 1 (from RefSeq NM_018961.4)
27ENSG00000272825n/a
    
    
     
n/achr21 44,936,628ENSG00000272825 (from geneSymbol)
28SIRPGn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 1,643,465signal regulatory protein gamma, transcript variant 1 (from RefSeq NM_018556.4)
29APOBEC3B-AS1n/a
    
    
     
n/achr22 38,994,884APOBEC3B antisense RNA 1 (from RefSeq NR_104187.1)
30MYL12BP2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 184,299,384myosin light chain 12B pseudogene 2 (from HGNC MYL12BP2)
31ENSG00000253690n/a
    
    
     
n/achr8 28,294,659ENSG00000253690 (from geneSymbol)
32POLQn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 121,488,709DNA polymerase theta (from RefSeq NM_199420.4)
33LY9n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 160,812,214lymphocyte antigen 9, transcript variant 1 (from RefSeq NM_002348.4)
34PIK3CGn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 106,887,131phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma, transcript variant 3 (from RefSeq NM_001282427.2)
35KIF14n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 200,586,125kinesin family member 14, transcript variant 1 (from RefSeq NM_014875.3)
36ENSG00000286030n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 35,522,624ENSG00000286030 (from geneSymbol)
37TOMM20P2n/a
    
    
     
n/achr17 35,514,976TOMM20 pseudogene 2 (from HGNC TOMM20P2)
38IFITM3P6n/a
    
    
     
n/achr12 47,135,699IFITM3P6 (from geneSymbol)
39ZDHHC20P1n/a
    
    
     
n/achr6 29,708,336zinc finger DHHC-type containing 20 pseudogene 1 (from HGNC ZDHHC20P1)
40SGO1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 20,177,845shugoshin 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001199251.3)
41KIF4An/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 70,355,495kinesin family member 4A (from RefSeq NM_012310.5)
42CD180n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 67,188,206CD180 molecule (from RefSeq NM_005582.3)
43SGO1-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 20,532,595SGO1 antisense RNA 1 (from HGNC SGO1-AS1)
44ENSG00000269954n/a
    
    
     
n/achr8 11,558,591ENSG00000269954 (from geneSymbol)
45GINS4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 41,537,145GINS complex subunit 4 (from RefSeq NM_032336.3)
46ENSG00000240535n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 55,034,261ENSG00000240535 (from geneSymbol)
47ENSG00000271680n/a
    
    
     
n/achr1 206,906,160ENSG00000271680 (from geneSymbol)
48XRCC2n/a
    
    
     
n/achr7 152,660,458X-ray repair cross complementing 2 (from RefSeq NM_005431.2)
49ENSG00000267554n/a
    
    
     
n/achr17 35,470,348ENSG00000267554 (from geneSymbol)
50ITGB2-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 44,925,364ITGB2 antisense RNA 1, transcript variant 6 (from RefSeq NR_038316.1)