UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1IGHV5-78n/a
    
    
     
n/achr14 106,851,270immunoglobulin heavy variable 5-78 (pseudogene) (from HGNC IGHV5-78)
2LINC02397n/a
    
    
     
n/achr12 92,479,271long intergenic non-protein coding RNA 2397 (from HGNC LINC02397)
3CLLU1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 92,426,259chronic lymphocytic leukemia up-regulated 1, transcript variant 2 (from RefSeq NR_027932.1)
4ENSG00000266923n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 92,452,605ENSG00000266923 (from geneSymbol)
5ENSG00000268088n/a
    
    
     
n/achr19 39,695,091ENSG00000268088 (from geneSymbol)
6ENSG00000263680n/a
    
    
     
n/achr17 72,427,395ENSG00000263680 (from geneSymbol)
7CNR2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 23,891,938cannabinoid receptor 2 (from RefSeq NM_001841.3)
8LGALS14n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 39,706,962galectin 14, transcript variant 1 (from RefSeq NM_020129.3)
9CCL3L3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17_KI270909v1_alt 251,521C-C motif chemokine ligand 3 like 1, transcript variant 2 (from RefSeq NR_111964.2)
10TNFSF11n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 42,591,082TNF superfamily member 11, transcript variant 1 (from RefSeq NM_003701.4)
11TRD-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 22,315,090TRD-AS1 (from geneSymbol)
12COX20P2n/a
    
    
     
n/achr2 230,957,771COX20, cytochrome c oxidase assembly factor pseudogene 2 (from HGNC COX20P2)
13ENSG00000253690n/a
    
    
     
n/achr8 28,294,659ENSG00000253690 (from geneSymbol)
14MYL12BP2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 184,299,384myosin light chain 12B pseudogene 2 (from HGNC MYL12BP2)
15LINC02947n/a
    
    
     
n/achr8 48,517,004LINC02947 (from geneSymbol)
16ENSG00000269954n/a
    
    
     
n/achr8 11,558,591ENSG00000269954 (from geneSymbol)
17IGHV1-3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 106,005,334V region of the variable domain of immunoglobulin heavy  chains that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A0C4DH29)
18MIR5195n/a
    
    
     
n/achr14 106,850,942microRNA 5195 (from RefSeq NR_049827.1)
19SERPINB10n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr18 63,922,034serpin family B member 10 (from RefSeq NM_005024.3)
20ENSG00000289724n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr18 63,907,332Protease inhibitor that may play a role in the regulation of  protease activities during hematopoiesis and apoptosis induced by TNF.  May regulate protease activities in the cytoplasm and in the nucleus. (from UniProt H7BYS2)
21MIR4496n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 108,635,840microRNA 4496 (from RefSeq NR_039717.1)
22LINC01307n/a
    
    
     
n/achr1 101,350,575long intergenic non-protein coding RNA 1307 (from RefSeq NR_126402.1)
23LINC00426n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 30,358,630long intergenic non-protein coding RNA 426 (from HGNC LINC00426)
24ESCO2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 27,789,935establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 2 (from RefSeq NM_001017420.3)
25CD180n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 67,188,206CD180 molecule (from RefSeq NM_005582.3)
26CARD11-AS1n/a
    
    
     
n/achr7 2,945,563CARD11 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_187443.1)
27NAALADL2-AS2n/a
    
    
     
n/achr3 175,252,978NAALADL2 antisense RNA 2 (from RefSeq NR_046713.1)
28RPL7P50n/a
    
    
     
n/achr19 6,593,692ribosomal protein L7 pseudogene 50 (from HGNC RPL7P50)
29IGKV5-2n/a
    
    
     
n/achr2 88,897,508V region of the variable domain of immunoglobulin light  chains that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:20176268, PubMed:22158414). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt P06315)
30ENSG00000271680n/a
    
    
     
n/achr1 206,906,160ENSG00000271680 (from geneSymbol)
31IGKV2-29n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 89,234,543immunoglobulin kappa variable 2-29 (gene/pseudogene) (from HGNC IGKV2-29)
32IGHV3-66n/a
    
    
     
n/achr14 106,675,280V region of the variable domain of immunoglobulin heavy  chains that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A0C4DH42)
33LRTM1n/a
    
    
     
n/achr3 54,923,145leucine rich repeats and transmembrane domains 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_020678.4)
34TRGV5Pn/a
    
    
     
n/achr7 38,345,264T cell receptor gamma variable 5P (pseudogene) (from HGNC TRGV5P)
35BFSP2n/a
    
    
     
n/achr3 133,437,632beaded filament structural protein 2 (from RefSeq NM_003571.4)
36TRGV5n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 38,349,688V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0B4J1U4)
37CLNKn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 10,585,581cytokine dependent hematopoietic cell linker (from RefSeq NM_052964.4)
38IGKV3D-15n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 90,115,120V region of the variable domain of immunoglobulin light  chains that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:20176268, PubMed:22158414). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A087WSY6)
39RPL13AP8n/a
    
    
     
n/achr1 206,907,924ribosomal protein L13a pseudogene 8 (from HGNC RPL13AP8)
40TRGV3n/a
    
    
     
n/achr7 38,358,837V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt P03979)
41IGLV3-16n/a
    
    
     
n/achr22 22,747,652V region of the variable domain of immunoglobulin light  chains that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:20176268, PubMed:22158414). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:17576170, PubMed:20176268). (from UniProt A0A075B6K0)
42MIR378In/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22 41,923,259microRNA 378i (from RefSeq NR_039760.1)
43E2F7n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 77,043,410E2F transcription factor 7 (from RefSeq NM_203394.3)
44PLA2G2Dn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 20,115,737phospholipase A2 group IID, transcript variant 1 (from RefSeq NM_012400.4)
45IGLV2-5n/a
    
    
     
n/achr22 22,856,900immunoglobulin lambda variable 2-5 (pseudogene) (from HGNC IGLV2-5)
46RPL10P1n/a
    
    
     
n/achr21 27,420,701ribosomal protein L10 pseudogene 1 (from HGNC RPL10P1)
47KIF14n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 200,586,125kinesin family member 14, transcript variant 1 (from RefSeq NM_014875.3)
48PIMREGn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 6,447,962PICALM interacting mitotic regulator, transcript variant 1 (from RefSeq NM_019013.3)
49ENSG00000230709n/a
    
    
     
n/achr17 16,978,676uncharacterized LOC284191 (from RefSeq NR_148948.1)
50IGHEn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 105,599,709Constant region of immunoglobulin heavy chains.  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:17576170, PubMed:20176268). (from UniProt P01854)