UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ENSG00000235419n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 230,550,300ENSG00000235419 (from geneSymbol)
2PLEKHA3P1n/a
    
    
     
n/achr19 41,521,516pleckstrin homology domain containing A3 pseudogene 1 (from HGNC PLEKHA3P1)
3E2F3P1n/a
    
    
     
n/achr17 35,490,623E2F transcription factor 3 pseudogene 1 (from HGNC E2F3P1)
4LINC01684n/a
    
    
     
n/achr21 24,418,852long intergenic non-protein coding RNA 1684 (from HGNC LINC01684)
5CENPUP2n/a
    
    
     
n/achr12 25,093,307centromere protein U pseudogene 2 (from HGNC CENPUP2)
6TRGV1n/a
    
    
     
n/achr7 38,367,877Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma chain  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive T cell receptor (TR) chain due to altered  V-(D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0A0MS02)
7ENSG00000262319n/a
    
    
     
n/achr17 19,142,353ENSG00000262319 (from geneSymbol)
8RPL31P11n/a
    
    
     
n/achr1 161,685,023ribosomal protein L31 pseudogene 11 (from HGNC RPL31P11)
9ENSG00000225885n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 118,345,906ENSG00000225885 (from geneSymbol)
10USP41Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22 20,370,436USP41P (from geneSymbol)
11ENSG00000262703n/a
    
    
     
n/achr16 11,348,732ENSG00000262703 (from geneSymbol)
12LINC01934n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 181,266,579long intergenic non-protein coding RNA 1934 (from RefSeq NR_130784.1)
13ENSG00000262810n/a
    
    
     
n/achr17 2,095,620ENSG00000262810 (from geneSymbol)
14ENSG00000279040n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 2,101,604ENSG00000279040 (from geneSymbol)
15RTEL1P1n/a
    
    
     
n/achr4 112,357,977regulator of telomere elongation helicase 1 pseudogene 1 (from HGNC RTEL1P1)
16ENSG00000293208n/a
    
    
     
n/achr4 112,365,372ENSG00000293208 (from geneSymbol)
17ATP5MC2P3n/a
    
    
     
n/achr2 197,263,323ATP synthase membrane subunit c locus 2 pseudogene 3 (from HGNC ATP5MC2P3)
18ENSG00000258760n/a
    
    
     
n/achr14 65,269,580ENSG00000258760 (from geneSymbol)
19ENSG00000248571n/a
    
    
     
n/achr4 152,668,237ENSG00000248571 (from geneSymbol)
20ENSG00000258878n/a
    
    
     
n/achr14 65,234,808ENSG00000258878 (from geneSymbol)
21HCCS-DTn/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 10,979,399HCCS divergent transcript, transcript variant 1 (from RefSeq NR_186561.1)
22ENSG00000238015n/a
    
    
     
n/achr1 78,666,483ENSG00000238015 (from geneSymbol)
23ENSG00000236941n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 164,948,758ENSG00000236941 (from geneSymbol)
24EEF1A1P10n/a
    
    
     
n/achr7 144,647,880eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1 pseudogene 10 (from HGNC EEF1A1P10)
25EIF4A1P4n/a
    
    
     
n/achr12 53,153,878eukaryotic translation initiation factor 4A1 pseudogene 4 (from HGNC EIF4A1P4)
26ENSG00000267312n/a
    
    
     
n/achr17 35,460,015ENSG00000267312 (from geneSymbol)
27ENSG00000237756n/a
    
    
     
n/achr1 163,260,254ENSG00000237756 (from geneSymbol)
28RPL23AP18n/a
    
    
     
n/achr1 212,309,284ribosomal protein L23a pseudogene 18 (from HGNC RPL23AP18)
29GLYATL1Bn/a
    
    
     
n/achr11 59,090,546glycine-N-acyltransferase like 1B (from RefSeq NM_001355566.1)
30AK4P4n/a
    
    
     
n/achr9 5,856,103adenylate kinase 4 pseudogene 4 (from HGNC AK4P4)
31IGHEn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 105,599,709Constant region of immunoglobulin heavy chains.  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:17576170, PubMed:20176268). (from UniProt P01854)
32ENSG00000267016n/a
    
    
     
n/achr17 77,470,966ENSG00000267016 (from geneSymbol)
33TTC4P1n/a
    
    
     
n/achr7 46,000,199tetratricopeptide repeat domain 4 pseudogene 1 (from HGNC TTC4P1)
34ENSG00000259421n/a
    
    
     
n/achr22 39,070,542ENSG00000259421 (from geneSymbol)
35TNIP3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 121,147,864TNFAIP3 interacting protein 3, transcript variant 1 (from RefSeq NM_024873.6)
36FCF1P1n/a
    
    
     
n/achr7 23,621,079FCF1 pseudogene 1 (from HGNC FCF1P1)
37RNY1P11n/a
    
    
     
n/achr7 129,164,905RNA, Ro-associated Y1 pseudogene 11 (from HGNC RNY1P11)
38ENSG00000279846n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 99,498,093ENSG00000279846 (from geneSymbol)
39RPL7AP21n/a
    
    
     
n/achr1 168,579,046ribosomal protein L7a pseudogene 21 (from HGNC RPL7AP21)
40NPM1P46n/a
    
    
     
n/achr2 197,380,296nucleophosmin 1 pseudogene 46 (from HGNC NPM1P46)
41HNRNPA3P3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 140,032,912heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 pseudogene 3 (from HGNC HNRNPA3P3)
42OR2B6n/a
    
    
     
n/achr6 27,957,711olfactory receptor family 2 subfamily B member 6 (from RefSeq NM_012367.1)
43RNU2-6Pn/a
    
    
     
n/achr13 46,374,495RNA, U2 small nuclear 6, pseudogene (from HGNC RNU2-6P)
44TPM3P8n/a
    
    
     
n/achr2 230,573,488tropomyosin 3 pseudogene 8 (from HGNC TPM3P8)
45ENSG00000256988n/a
    
    
     
n/achr12 4,817,638ENSG00000256988 (from geneSymbol)
46ENSG00000268289n/a
    
    
     
n/achr19 17,053,540ENSG00000268289 (from geneSymbol)
47SCAT1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 78,620,016SCAT1 (from geneSymbol)
48ENSG00000251288n/a
    
    
     
n/achr4 102,752,021ENSG00000251288 (from geneSymbol)
49DCAF13P1n/a
    
    
     
n/achr7 106,126,035DDB1 and CUL4 associated factor 13 pseudogene 1 (from HGNC DCAF13P1)
50LINC02909n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 25,000,733LINC02909 (from geneSymbol)