UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ABCC13n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 14,318,423ATP binding cassette subfamily C member 13 (pseudogene) (from HGNC ABCC13)
2ABCC13n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 14,305,908ATP binding cassette subfamily C member 13 (pseudogene) (from HGNC ABCC13)
3MIR559n/a
    
    
     
n/achr2 47,377,722microRNA 559 (from RefSeq NR_030286.1)
4RPS29P12n/a
    
    
     
n/achr5 180,945,831ribosomal protein S29 pseudogene 12 (from HGNC RPS29P12)
5TMEM236n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 17,776,534transmembrane protein 236 (from RefSeq NM_001098844.3)
6RN7SL541Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 134,517,951RNA, 7SL, cytoplasmic 541, pseudogene (from HGNC RN7SL541P)
7ENSG00000232175n/a
    
    
     
n/achr1 232,917,626ENSG00000232175 (from geneSymbol)
8ENSG00000232806n/a
    
    
     
n/achr21 41,561,041ENSG00000232806 (from geneSymbol)
9LINC00974n/a
    
    
     
n/achr17 41,552,050long intergenic non-protein coding RNA 974 (from RefSeq NR_038442.1)
10BOLA3P3n/a
    
    
     
n/achr5 126,663,452bolA family member 3 pseudogene 3 (from HGNC BOLA3P3)
11HTR3En/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 184,102,0295-hydroxytryptamine receptor 3E, transcript variant 4 (from RefSeq NM_001256613.2)
12Y_RNAn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 44,344,886Y_RNA (from geneSymbol)
13LINC02023n/a
    
    
     
n/achr3 165,154,034long intergenic non-protein coding RNA 2023 (from HGNC LINC02023)
14HNRNPA1P26n/a
    
    
     
n/achrX 100,855,833heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 pseudogene 26 (from HGNC HNRNPA1P26)
15LCTn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 135,812,517lactase (from RefSeq NM_002299.4)
16UBE2V2P1n/a
    
    
     
n/achr10 19,051,812ubiquitin conjugating enzyme E2 V2 pseudogene 1 (from HGNC UBE2V2P1)
17ENSG00000250137n/a
    
    
     
n/achr4 23,765,776ENSG00000250137 (from geneSymbol)
18RPL6P23n/a
    
    
     
n/achr8 94,202,482RPL6P23 (from geneSymbol)
19LINC01648n/a
    
    
     
n/achr1 30,025,782long intergenic non-protein coding RNA 1648 (from RefSeq NR_110790.1)
20RAD17P1n/a
    
    
     
n/achr7 16,865,287RAD17 checkpoint clamp loader component pseudogene 1 (from HGNC RAD17P1)
21HNRNPA1P52n/a
    
    
     
n/achr19 41,830,315heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 pseudogene 52 (from HGNC HNRNPA1P52)
22CLEC6An/a
    
    
     
n/achr12 8,467,146C-type lectin domain containing 6A, transcript variant 2 (from RefSeq NM_001317999.2)
23TREML5Pn/a
    
    
     
n/achr6 41,248,509triggering receptor expressed on myeloid cells like 5, pseudogene (from HGNC TREML5P)
24ENSG00000226041n/a
    
    
     
n/achr2 16,203,328ENSG00000226041 (from geneSymbol)
25IGHVII-78-1n/a
    
    
     
n/achr14 106,865,761immunoglobulin heavy variable (II)-78-1 (pseudogene) (from HGNC IGHVII-78-1)
26ENSG00000225402n/a
    
    
     
n/achr2 37,817,438ENSG00000225402 (from geneSymbol)
27HMGB1P49n/a
    
    
     
n/achr12 27,702,622high mobility group box 1 pseudogene 49 (from HGNC HMGB1P49)
28MTND5P32n/a
    
    
     
n/achr15 58,153,506mitochondrially encoded NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit 5 pseudogene 32 (from HGNC MTND5P32)
29CABP5n/a
    
    
     
n/achr19 48,036,731calcium binding protein 5 (from RefSeq NM_019855.5)
30ENSG00000271302n/a
    
    
     
n/achr4 121,118,516ENSG00000271302 (from geneSymbol)
31ENSG00000232208n/a
    
    
     
n/achr1 8,907,568ENSG00000232208 (from geneSymbol)
32IGHV3-79n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 106,867,876immunoglobulin heavy variable 3-79 (pseudogene) (from HGNC IGHV3-79)
33RNU6-140Pn/a
    
    
     
n/achr19 38,797,055RNA, U6 small nuclear 140, pseudogene (from HGNC RNU6-140P)
34FOLR1P1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 72,159,278folate receptor 1 pseudogene 1 (from HGNC FOLR1P1)
35SDR42E1P5n/a
    
    
     
n/achr2 102,411,675short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1 pseudogene 5 (from HGNC SDR42E1P5)
36HNRNPA1P17n/a
    
    
     
n/achr3 108,326,167heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 pseudogene 17 (from HGNC HNRNPA1P17)
37TRAV36DV7n/a
    
    
     
n/achr14 22,227,000V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A075B6V5)
38TRAV1-1n/a
    
    
     
n/achr14 21,622,202V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0B4J248)
39BUB1P1n/a
    
    
     
n/achr10 127,868,184BUB1 mitotic checkpoint serine/threonine kinase pseudogene 1 (from HGNC BUB1P1)
40TPRKBP2n/a
    
    
     
n/achr16 28,111,410TP53RK binding protein pseudogene 2 (from HGNC TPRKBP2)
41SLC18A1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 20,163,995solute carrier family 18 member A1, transcript variant 2 (from RefSeq NM_003053.4)
42ENSG00000229405n/a
    
    
     
n/achr2 7,736,766ENSG00000229405 (from geneSymbol)
43RNU2-33Pn/a
    
    
     
n/achr14 96,384,719RNA, U2 small nuclear 33, pseudogene (from HGNC RNU2-33P)
44CSF2RBP1n/a
    
    
     
n/achr22 36,952,126colony stimulating factor 2 receptor beta common subunit pseudogene 1 (from HGNC CSF2RBP1)
45MTCO3P5n/a
    
    
     
n/achr2 143,099,415mitochondrially encoded cytochrome c oxidase III pseudogene 5 (from HGNC MTCO3P5)
46GOLGA5P1n/a
    
    
     
n/achr5 39,169,772golgin A5 pseudogene 1 (from HGNC GOLGA5P1)
47ENSG00000270182n/a
    
    
     
n/achr7 27,158,660ENSG00000270182 (from geneSymbol)
48RNA5SP434n/a
    
    
     
n/achr17 4,056,816RNA, 5S ribosomal pseudogene 434 (from HGNC RNA5SP434)
49DGAT2L7Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 101,202,667diacylglycerol O-acyltransferase 2 like 7, pseudogene (from HGNC DGAT2L7P)
50RPS4XP7n/a
    
    
     
n/achr6 13,521,655ribosomal protein S4X pseudogene 7 (from HGNC RPS4XP7)