UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1RN7SL105Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 1,604,523RNA, 7SL, cytoplasmic 105, pseudogene (from HGNC RN7SL105P)
2KIR2DL1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,777,057killer cell immunoglobulin like receptor, two Ig domains and long cytoplasmic tail 1 (from RefSeq NM_014218.3)
3ENSG00000215765n/a
    
    
     
n/achr19 54,761,390ENSG00000215765 (from geneSymbol)
4TRAV34n/a
    
    
     
n/achr14 22,207,825V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0B4J273)
5ENSG00000254649n/a
    
    
     
n/achr11 78,390,233ENSG00000254649 (from geneSymbol)
6ENSG00000257691n/a
    
    
     
n/achr16 29,475,209ENSG00000257691 (from geneSymbol)
7HMGB1P9n/a
    
    
     
n/achr2 218,200,911high mobility group box 1 pseudogene 9 (from HGNC HMGB1P9)
8PRELID3BP6n/a
    
    
     
n/achr5 42,917,699PRELI domain containing 3B pseudogene 6 (from HGNC PRELID3BP6)
9ENSG00000258115n/a
    
    
     
n/achr12 72,051,763ENSG00000258115 (from geneSymbol)
10IGHV3-52n/a
    
    
     
n/achr14 106,586,601immunoglobulin heavy variable 3-52 (pseudogene) (from HGNC IGHV3-52)
11IGHVII-60-1n/a
    
    
     
n/achr14 106,637,845immunoglobulin heavy variable (II)-60-1 (pseudogene) (from HGNC IGHVII-60-1)
12IGHV1-14n/a
    
    
     
n/achr14 106,146,011immunoglobulin heavy variable 1-14 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-14)
13ENSG00000224523n/a
    
    
     
n/achrX 81,418,107ENSG00000224523 (from geneSymbol)
14RCBTB2P1n/a
    
    
     
n/achr10 88,786,330RCC1 and BTB domain containing protein 2 pseudogene 1 (from HGNC RCBTB2P1)
15CEACAMP3n/a
    
    
     
n/achr19 41,602,478carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule pseudogene 3 (from HGNC CEACAMP3)
16ENSG00000291001n/a
    
    
     
n/achr19 41,604,113ENSG00000291001 (from geneSymbol)
17ENSG00000259962n/a
    
    
     
n/achr16 53,362,848ENSG00000259962 (from geneSymbol)
18ENSG00000257094n/a
    
    
     
n/achr12 32,007,281ENSG00000257094 (from geneSymbol)
19ENSG00000254325n/a
    
    
     
n/achr8 55,894,667ENSG00000254325 (from geneSymbol)
20RNU6-226Pn/a
    
    
     
n/achr5 175,703,951RNA, U6 small nuclear 226, pseudogene (from HGNC RNU6-226P)
21IGLV3-13n/a
    
    
     
n/achr22 22,762,405immunoglobulin lambda variable 3-13 (pseudogene) (from HGNC IGLV3-13)
22PPIAP60n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 11,351,872peptidylprolyl isomerase A pseudogene 60 (from HGNC PPIAP60)
23PLA2G10HPn/a
    
    
     
n/achr16 29,480,735PLA2G10HP (from geneSymbol)
24DPY19L4P1n/a
    
    
     
n/achr1 248,772,713DPY19L4P1 (from geneSymbol)
25ENSG00000260335n/a
    
    
     
n/achr16 29,449,408ENSG00000260335 (from geneSymbol)
26OR9G4n/a
    
    
     
n/achr11 56,744,960olfactory receptor family 9 subfamily G member 4, transcript variant 2 (from RefSeq NM_001390832.1)
27IGKV2D-23n/a
    
    
     
n/achr2 90,009,664immunoglobulin kappa variable 2D-23 (pseudogene) (from HGNC IGKV2D-23)
28SEPTIN7P8n/a
    
    
     
n/achr19 53,772,893SEPTIN7P8 (from geneSymbol)
29RN7SL587Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 77,547,706RNA, 7SL, cytoplasmic 587, pseudogene (from HGNC RN7SL587P)
30IGHV1-12n/a
    
    
     
n/achr14 106,122,564immunoglobulin heavy variable 1-12 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-12)
31MIR144n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 28,861,575microRNA 144 (from RefSeq NR_029685.1)
32MIR4732n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 28,861,692microRNA 4732 (from RefSeq NR_039885.1)
33MIR451An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 28,861,404microRNA 451a (from RefSeq NR_029970.1)
34OR7E149Pn/a
    
    
     
n/achr12 8,437,914olfactory receptor family 7 subfamily E member 149 pseudogene (from HGNC OR7E149P)
35IGHV1-67n/a
    
    
     
n/achr14 106,680,822immunoglobulin heavy variable 1-67 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-67)
36LGALS9DPn/a
    
    
     
n/achr17 27,750,543galectin 9D, pseudogene (from HGNC LGALS9DP)
37ENSG00000251431n/a
    
    
     
n/achr19 54,298,459ENSG00000251431 (from geneSymbol)
38GTF3AP2n/a
    
    
     
n/achr14 71,044,507general transcription factor IIIA pseudogene 2 (from HGNC GTF3AP2)
39ENSG00000276636n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22_KI270879v1_alt 262,993ENSG00000276636 (from geneSymbol)
40IGLVI-63n/a
    
    
     
n/achr22 22,080,016immunoglobulin lambda variable (I)-63 (pseudogene) (from HGNC IGLVI-63)
41ENSG00000270512n/a
    
    
     
n/achr7 140,282,692ENSG00000270512 (from geneSymbol)
42ENSG00000224579n/a
    
    
     
n/achr19 54,209,255ENSG00000224579 (from geneSymbol)
43GCSHP4n/a
    
    
     
n/achr12 8,141,932glycine cleavage system protein H pseudogene 4 (from HGNC GCSHP4)
44PFDN1P2n/a
    
    
     
n/achr4 15,743,389PFDN1P2 (from geneSymbol)
45IGHV3-71n/a
    
    
     
n/achr14 106,775,387immunoglobulin heavy variable 3-71 (pseudogene) (from HGNC IGHV3-71)
46RPS20P32n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 27,017,731ribosomal protein S20 pseudogene 32 (from HGNC RPS20P32)
47NUTF2P7n/a
    
    
     
n/achrX 71,016,718nuclear transport factor 2 pseudogene 7 (from HGNC NUTF2P7)
48RN7SKP1n/a
    
    
     
n/achr13 37,166,505RNA, 7SK small nuclear pseudogene 1 (from HGNC RN7SKP1)
49IKBKGP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 154,644,126inhibitor of nuclear factor kappa B kinase subunit gamma pseudogene 1 (from HGNC IKBKGP1)
50IGKV1OR2-1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 91,818,009immunoglobulin kappa variable 1/OR2-1 (pseudogene) (from HGNC IGKV1OR2-1)