UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ENSG00000257452n/a
    
    
     
n/achr12 112,962,689ENSG00000257452 (from geneSymbol)
2ENSG00000286030n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 35,522,624ENSG00000286030 (from geneSymbol)
3ERCC6Ln/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 72,221,846ERCC excision repair 6 like, spindle assembly checkpoint helicase, transcript variant 1 (from RefSeq NM_017669.4)
4ENSG00000262151n/a
    
    
     
n/achr16 10,876,833ENSG00000262151 (from geneSymbol)
5TOMM20P2n/a
    
    
     
n/achr17 35,514,976TOMM20 pseudogene 2 (from HGNC TOMM20P2)
6ENSG00000269050n/a
    
    
     
n/achr19 38,871,961ENSG00000269050 (from geneSymbol)
7LINC01150n/a
    
    
     
n/achr11 1,902,835long intergenic non-protein coding RNA 1150 (from HGNC LINC01150)
8ENSG00000225931n/a
    
    
     
n/achr1 2,568,149ENSG00000225931 (from geneSymbol)
9TRGV5n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 38,349,688V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0B4J1U4)
10UNC93B5n/a
    
    
     
n/achr11 67,713,853unc-93 homolog B5, pseudogene (from HGNC UNC93B5)
11RPL17P28n/a
    
    
     
n/achr7 139,049,731ribosomal protein L17 pseudogene 28 (from HGNC RPL17P28)
12SGO1-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 20,532,595SGO1 antisense RNA 1 (from HGNC SGO1-AS1)
13MIR4496n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 108,635,840microRNA 4496 (from RefSeq NR_039717.1)
14RGS17P1n/a
    
    
     
n/achr13 40,993,055regulator of G protein signaling 17 pseudogene 1 (from HGNC RGS17P1)
15PSME2P1n/a
    
    
     
n/achr5 98,213,761proteasome activator subunit 2 pseudogene 1 (from HGNC PSME2P1)
16ENSG00000267349n/a
    
    
     
n/achr17 35,478,219ENSG00000267349 (from geneSymbol)
17FANCBn/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 14,858,237FA complementation group B, transcript variant 3 (from RefSeq NM_001324162.2)
18IL9RP3n/a
    
    
     
n/achr16 33,828interleukin 9 receptor pseudogene 3 (from HGNC IL9RP3)
19NEIL3n/a
    
    
     
n/achr4 177,336,405nei like DNA glycosylase 3 (from RefSeq NM_018248.3)
20ENSG00000265334n/a
    
    
     
n/achr17 30,848,676ENSG00000265334 (from geneSymbol)
21OGFRP1n/a
    
    
     
n/achr22 42,274,639opioid growth factor receptor pseudogene 1 (from HGNC OGFRP1)
22ENSG00000234211n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 161,673,401ENSG00000234211 (from geneSymbol)
23SNX29P1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 21,381,356sorting nexin 29 pseudogene 1 (from HGNC SNX29P1)
24DOCK8-AS2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 473,276DOCK8-AS2 (from geneSymbol)
25PLCB2-AS1n/a
    
    
     
n/achr15 40,301,245PLCB2 antisense RNA 1 (from HGNC PLCB2-AS1)
26TRGV3n/a
    
    
     
n/achr7 38,358,837V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt P03979)
27ENSG00000223886n/a
    
    
     
n/achr7 105,530,440ENSG00000223886 (from geneSymbol)
28ENSG00000253882n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 143,833,557ENSG00000253882 (from geneSymbol)
29TCAF2Cn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 143,643,438TRPM8 channel associated factor 2C (from HGNC TCAF2C)
30RPL32P11n/a
    
    
     
n/achr3 25,749,692ribosomal protein L32 pseudogene 11 (from HGNC RPL32P11)
31ARID3BP1n/a
    
    
     
n/achr1 81,502,631ARID3BP1 (from geneSymbol)
32ENSG00000269161n/a
    
    
     
n/achr19 17,519,447ENSG00000269161 (from geneSymbol)
33KRT8P46n/a
    
    
     
n/achr4 102,729,458keratin 8 pseudogene 46 (from HGNC KRT8P46)
34PRADC1P1n/a
    
    
     
n/achr3 36,976,578protease associated domain containing 1 pseudogene 1 (from HGNC PRADC1P1)
35RPS12P20n/a
    
    
     
n/achr11 72,708,375ribosomal protein S12 pseudogene 20 (from HGNC RPS12P20)
36ENSG00000254503n/a
    
    
     
n/achr19 17,417,659ENSG00000254503 (from geneSymbol)
37ENSG00000272211n/a
    
    
     
n/achr2 196,153,072ENSG00000272211 (from geneSymbol)
38LINC02605n/a
    
    
     
n/achr8 78,837,916long intergenic non-protein coding RNA 2605 (from RefSeq NR_157588.1)
39TUBB8P1n/a
    
    
     
n/achr9 21,811,984tubulin beta 8 class VIII pseudogene 1 (from HGNC TUBB8P1)
40BFSP2n/a
    
    
     
n/achr3 133,437,632beaded filament structural protein 2 (from RefSeq NM_003571.4)
41ARPC3P1n/a
    
    
     
n/achr20 49,134,746actin related protein 2/3 complex subunit 3 pseudogene 1 (from HGNC ARPC3P1)
42ANP32AP1n/a
    
    
     
n/achr15 35,237,694acidic nuclear phosphoprotein 32 family member A pseudogene 1 (from RefSeq NR_003144.2)
43ENSG00000293367n/a
    
    
     
n/achr15 35,209,998ENSG00000293367 (from geneSymbol)
44PAICSP4n/a
    
    
     
n/achr8 4,787,958phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, phosphoribosylaminoimidazole succinocarboxamide synthetase pseudogene 4 (from HGNC PAICSP4)
45RPS26P6n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 100,895,944ribosomal protein S26 pseudogene 6 (from HGNC RPS26P6)
46ENSG00000240652n/a
    
    
     
n/achr11 107,908,592ENSG00000240652 (from geneSymbol)
47TBCAP3n/a
    
    
     
n/achr4 98,909,692tubulin folding cofactor A pseudogene 3 (from HGNC TBCAP3)
48ENSG00000225187n/a
    
    
     
n/achr2 47,069,513ENSG00000225187 (from geneSymbol)
49GPR82n/a
    
    
     
n/achrX 41,727,155G protein-coupled receptor 82 (from RefSeq NM_080817.5)
50ENSG00000243403n/a
    
    
     
n/achr15 64,593,152ENSG00000243403 (from geneSymbol)