UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1PMM2P2n/a
    
    
     
n/achr18 12,192,568phosphomannomutase 2 pseudogene 2 (from HGNC PMM2P2)
2ENSG00000226535n/a
    
    
     
n/achr9 107,170,358ENSG00000226535 (from geneSymbol)
3TRBV6-7n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 471,654Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of T cell receptor (TR) beta chain  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive T cell receptor (TR) chain due to altered  V-(D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0A0MS04)
4ENSG00000230121n/a
    
    
     
n/achr10 7,534,886uncharacterized LOC105376390 (from RefSeq NR_188188.1)
5MIX23P3n/a
    
    
     
n/achr18 12,211,592MIX23P3 (from geneSymbol)
6ANKEF1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 10,046,645ankyrin repeat and EF-hand domain containing 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_022096.6)
7ENSG00000234173n/a
    
    
     
n/achr10 54,571,140uncharacterized LOC105378311 (from RefSeq NR_134503.1)
8ENSG00000250712n/a
    
    
     
n/achr4 165,011,155ENSG00000250712 (from geneSymbol)
9IL31n/a
    
    
     
n/achr12 122,173,125interleukin 31 (from RefSeq NM_001014336.2)
10RN7SKP114n/a
    
    
     
n/achr9 34,050,105RNA, 7SK small nuclear pseudogene 114 (from HGNC RN7SKP114)
11LINC01441n/a
    
    
     
n/achr20 55,423,766long intergenic non-protein coding RNA 1441 (from RefSeq NR_110064.1)
12ENSG00000227809n/a
    
    
     
n/achr9 74,378,199ENSG00000227809 (from geneSymbol)
13BNIP3P31n/a
    
    
     
n/achr19 22,299,422BCL2 interacting protein 3 pseudogene 31 (from HGNC BNIP3P31)
14ENSG00000288225n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 41,644,597ENSG00000288225 (from geneSymbol)
15CRIPTOP2n/a
    
    
     
n/achr2 227,870,363CRIPTOP2 (from geneSymbol)
16SNORA70n/a
    
    
     
n/achr8 5,128,345small nucleolar RNA, H/ACA box 70 (from HGNC SNORA70)
17RPS10P29n/a
    
    
     
n/achr22 24,269,740ribosomal protein S10 pseudogene 29 (from HGNC RPS10P29)
18ZBTB20-AS3n/a
    
    
     
n/achr3 114,874,814ZBTB20 antisense RNA 3 (from RefSeq NR_126422.1)
19ENSG00000250193n/a
    
    
     
n/achr4 129,302,098ENSG00000250193 (from geneSymbol)
20ENSG00000253424n/a
    
    
     
n/achr5 158,257,286ENSG00000253424 (from geneSymbol)
21ENSG00000253499n/a
    
    
     
n/achr8 114,318,655ENSG00000253499 (from geneSymbol)
22OR10G4n/a
    
    
     
n/achr11 124,015,864olfactory receptor family 10 subfamily G member 4 (from RefSeq NM_001004462.2)
23ENSG00000259312n/a
    
    
     
n/achr15 96,441,418ENSG00000259312 (from geneSymbol)
24OR14K1n/a
    
    
     
n/achr1 247,739,087olfactory receptor family 14 subfamily K member 1 (from RefSeq NM_001004732.2)
25HES3n/a
    
    
     
n/achr1 6,244,878hes family bHLH transcription factor 3 (from RefSeq NM_001024598.4)
26ENSG00000224529n/a
    
    
     
n/achr2 208,136,545ENSG00000224529 (from geneSymbol)
27NDUFB1P1n/a
    
    
     
n/achr3 48,181,636NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B1 pseudogene 1 (from HGNC NDUFB1P1)
28ENSG00000257587n/a
    
    
     
n/achr12 73,913,138ENSG00000257587 (from geneSymbol)
29ZNF716n/a
    
    
     
n/achr7 57,461,868zinc finger protein 716 (from RefSeq NM_001159279.1)
30ENSG00000223753n/a
    
    
     
n/achrX 101,684,114ENSG00000223753 (from geneSymbol)
31LINC01039n/a
    
    
     
n/achr13 99,578,740long intergenic non-protein coding RNA 1039 (from RefSeq NR_126390.1)
32ENSG00000234275n/a
    
    
     
n/achr2 6,300,065ENSG00000234275 (from geneSymbol)
33LINC01448n/a
    
    
     
n/achr7 42,684,081long intergenic non-protein coding RNA 1448 (from RefSeq NR_110833.1)
34KRTAP5-13Pn/a
    
    
     
n/achr11 71,568,807keratin associated protein 5-13, pseudogene (from HGNC KRTAP5-13P)
35CRIP1P4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22 24,712,406cysteine rich protein 1 pseudogene 4 (from HGNC CRIP1P4)
36ENSG00000229762n/a
    
    
     
n/achr7 55,811,095ENSG00000229762 (from geneSymbol)
37ENSG00000232309n/a
    
    
     
n/achr1 182,127,989ENSG00000232309 (from geneSymbol)
38RPL13AP21n/a
    
    
     
n/achr12 46,004,361ribosomal protein L13a pseudogene 21 (from HGNC RPL13AP21)
39ENSG00000250887n/a
    
    
     
n/achr4 165,007,522ENSG00000250887 (from geneSymbol)
40ENSG00000260959n/a
    
    
     
n/achr15 24,239,168ENSG00000260959 (from geneSymbol)
41ENSG00000261111n/a
    
    
     
n/achr16 32,635,859ENSG00000261111 (from geneSymbol)
42Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr17 50,386,195Y_RNA (from geneSymbol)
43NPM1P38n/a
    
    
     
n/achr6 100,050,804nucleophosmin 1 pseudogene 38 (from HGNC NPM1P38)
44DSCR4-IT1n/a
    
    
     
n/achr21 38,008,581DSCR4 intronic transcript 1 (from HGNC DSCR4-IT1)
45IGHV3OR16-10n/a
    
    
     
n/achr16 32,995,276Immunoglobulins are composed of two identical heavy chains and  two identical light chains; disulfide-linked. (from UniProt A0A075B7F0)
46ENSG00000242536n/a
    
    
     
n/achr3 157,951,902ENSG00000242536 (from geneSymbol)
47ENSG00000244510n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 66,485,251ENSG00000244510 (from geneSymbol)
48ENSG00000250200n/a
    
    
     
n/achr4 174,923,925ENSG00000250200 (from geneSymbol)
49ENSG00000258503n/a
    
    
     
n/achr14 53,012,119ENSG00000258503 (from geneSymbol)
50RNU6-704Pn/a
    
    
     
n/achr1 200,933,396RNA, U6 small nuclear 704, pseudogene (from HGNC RNU6-704P)