UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ENSG00000267554n/a
    
    
     
n/achr17 35,470,348ENSG00000267554 (from geneSymbol)
2ENSG00000267074n/a
    
    
     
n/achr17 35,504,980ENSG00000267074 (from geneSymbol)
3LAX1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 203,770,777lymphocyte transmembrane adaptor 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_017773.4)
4GVINP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 6,718,245GTPase, very large interferon inducible pseudogene 1 (from RefSeq NR_003945.1)
5TRGV3n/a
    
    
     
n/achr7 38,358,837V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt P03979)
6ENSG00000286030n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 35,522,624ENSG00000286030 (from geneSymbol)
7LINC00426n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 30,358,630long intergenic non-protein coding RNA 426 (from HGNC LINC00426)
8CTLA4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 203,870,868cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4, transcript variant 1 (from RefSeq NM_005214.5)
9CD28n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 203,722,775CD28 molecule, transcript variant 1 (from RefSeq NM_006139.4)
10TOMM20P2n/a
    
    
     
n/achr17 35,514,976TOMM20 pseudogene 2 (from HGNC TOMM20P2)
11UBASH3An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 42,425,793ubiquitin associated and SH3 domain containing A, transcript variant 1 (from RefSeq NM_018961.4)
12TRGV4n/a
    
    
     
n/achr7 38,354,116V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0C4DH28)
13ENSG00000269050n/a
    
    
     
n/achr19 38,871,961ENSG00000269050 (from geneSymbol)
14ENSG00000257452n/a
    
    
     
n/achr12 112,962,689ENSG00000257452 (from geneSymbol)
15TIGITn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 114,302,158T cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains (from RefSeq NM_173799.4)
16NAP1L4P1n/a
    
    
     
n/achr1 116,533,514nucleosome assembly protein 1 like 4 pseudogene 1 (from HGNC NAP1L4P1)
17XCL1n/a
    
    
     
n/achr1 168,579,337X-C motif chemokine ligand 1 (from RefSeq NM_002995.3)
18BET1P1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 150,749,915Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein pseudogene 1 (from HGNC BET1P1)
19KCNA3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 110,673,702potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, transcript variant 1 (from RefSeq NM_002232.5)
20PYHIN1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 158,954,305pyrin and HIN domain family member 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_152501.5)
21MIR92A1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 91,351,352microRNA 92a-1 (from RefSeq NR_029508.1)
22MIR20An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 91,351,100microRNA 20a (from RefSeq NR_029492.1)
23MIR18An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 91,350,786microRNA 18a (from RefSeq NR_029488.1)
24MIR19An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 91,350,931microRNA 19a (from RefSeq NR_029489.1)
25MIR19B1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 91,351,235microRNA 19b-1 (from RefSeq NR_029490.1)
26MIR17n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 91,350,646microRNA 17 (from RefSeq NR_029487.1)
27KLHDC7Bn/a
    
    
     
n/achr22 50,548,461kelch domain containing 7B (from RefSeq NM_138433.5)
28TRGV5Pn/a
    
    
     
n/achr7 38,345,264T cell receptor gamma variable 5P (pseudogene) (from HGNC TRGV5P)
29TRAT1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 108,838,895T cell receptor associated transmembrane adaptor 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_016388.4)
30PIK3CGn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 106,887,131phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma, transcript variant 3 (from RefSeq NM_001282427.2)
31RPL32P1n/a
    
    
     
n/achr6 33,079,655ribosomal protein L32 pseudogene 1 (from HGNC RPL32P1)
32ZDHHC20P1n/a
    
    
     
n/achr6 29,708,336zinc finger DHHC-type containing 20 pseudogene 1 (from HGNC ZDHHC20P1)
33LAIR1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,358,157leukocyte associated immunoglobulin like receptor 1, transcript variant h (from RefSeq NR_110279.3)
34CD200R1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 112,948,154CD200 receptor 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_138806.4)
35UNC93B5n/a
    
    
     
n/achr11 67,713,853unc-93 homolog B5, pseudogene (from HGNC UNC93B5)
36ENSG00000262312n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 3,544,126ENSG00000262312 (from geneSymbol)
37LINC03058n/a
    
    
     
n/achr14 20,784,090LINC03058 (from geneSymbol)
38IL10n/a
    
    
     
n/achr1 206,770,048interleukin 10, transcript variant 3 (from RefSeq NR_168466.1)
39ENSG00000217078n/a
    
    
     
n/achr6 16,163,569ENSG00000217078 (from geneSymbol)
40SNORD17n/a
    
    
     
n/achr20 17,962,828small nucleolar RNA, C/D box 17 (from RefSeq NR_003045.1)
41ENSG00000237568n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 89,265,168ENSG00000237568 (from geneSymbol)
42CYLD-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 50,735,116CYLD antisense RNA 1, transcript variant 7 (from RefSeq NR_184279.1)
43FASLGn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 172,662,989Fas ligand, transcript variant 1 (from RefSeq NM_000639.3)
44ERCC6Ln/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 72,221,846ERCC excision repair 6 like, spindle assembly checkpoint helicase, transcript variant 1 (from RefSeq NM_017669.4)
45APOBEC3B-AS1n/a
    
    
     
n/achr22 38,994,884APOBEC3B antisense RNA 1 (from RefSeq NR_104187.1)
46PDE6Gn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 81,653,500phosphodiesterase 6G, transcript variant 1 (from RefSeq NM_002602.4)
47PTPRN2-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 157,856,190PTPRN2 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_038966.1)
48RGS17P1n/a
    
    
     
n/achr13 40,993,055regulator of G protein signaling 17 pseudogene 1 (from HGNC RGS17P1)
49IFITM3P6n/a
    
    
     
n/achr12 47,135,699IFITM3P6 (from geneSymbol)
50ENSG00000262151n/a
    
    
     
n/achr16 10,876,833ENSG00000262151 (from geneSymbol)