UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1TRBV6-7n/a
n/a
n/a
n/a
4e-64chr7_KI270803v1_alt 471,654Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of T cell receptor (TR) beta chain  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive T cell receptor (TR) chain due to altered  V-(D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0A0MS04)
2KRT18P40n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 20,963,098keratin 18 pseudogene 40 (from HGNC KRT18P40)
3ENSG00000229066n/a
    
    
     
n/achr2 175,360,271ENSG00000229066 (from geneSymbol)
4OR5H5Pn/a
    
    
     
n/achr3 98,197,674olfactory receptor family 5 subfamily H member 5 pseudogene (from HGNC OR5H5P)
5ENSG00000226927n/a
    
    
     
n/achr1 220,359,957ENSG00000226927 (from geneSymbol)
6RNF11P2n/a
    
    
     
n/achr20 14,547,403ring finger protein 11 pseudogene 2 (from HGNC RNF11P2)
7TRMT1P1n/a
    
    
     
n/achrX 145,631,296TRMT1P1 (from geneSymbol)
8ENSG00000257754n/a
    
    
     
n/achr12 103,820,847ENSG00000257754 (from geneSymbol)
9RN7SL678Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 37,215,754RNA, 7SL, cytoplasmic 678, pseudogene (from HGNC RN7SL678P)
10ZNF705Bn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 7,939,375zinc finger protein 705B (from RefSeq NM_001193630.1)
11RPL6P17n/a
    
    
     
n/achr6 15,103,538ribosomal protein L6 pseudogene 17 (from HGNC RPL6P17)
12ENSG00000227015n/a
    
    
     
n/achr7 57,770,782ENSG00000227015 (from geneSymbol)
13ENSG00000237297n/a
    
    
     
n/achr10 45,798ENSG00000237297 (from geneSymbol)
14RPL21P114n/a
    
    
     
n/achr15 59,525,651ribosomal protein L21 pseudogene 114 (from HGNC RPL21P114)
15ENSG00000255164n/a
    
    
     
n/achr8 144,993,875ENSG00000255164 (from geneSymbol)
16ENSG00000271129n/a
    
    
     
n/achr16 69,026,251ENSG00000271129 (from geneSymbol)
17ZIM3n/a
    
    
     
n/achr19 57,139,649zinc finger imprinted 3 (from RefSeq NM_052882.1)
18FTH1P14n/a
    
    
     
n/achrX 34,147,311ferritin heavy chain 1 pseudogene 14 (from HGNC FTH1P14)
19GPX6n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 28,509,544glutathione peroxidase 6 (from RefSeq NM_182701.1)
20NANOGNBn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 7,769,668NANOG neighbor homeobox (from RefSeq NM_001145465.1)
21ENSG00000233960n/a
    
    
     
n/achr7 52,179,074ENSG00000233960 (from geneSymbol)
22ENSG00000236495n/a
    
    
     
n/achr10 14,656,635ENSG00000236495 (from geneSymbol)
23ENSG00000255184n/a
    
    
     
n/achr11 90,021,061ENSG00000255184 (from geneSymbol)
24OR5AZ1Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 57,917,768olfactory receptor family 5 subfamily AZ member 1 pseudogene (from HGNC OR5AZ1P)
25ZNF734Pn/a
    
    
     
n/achr7 63,453,253zinc finger protein 734, pseudogene (from HGNC ZNF734P)
26SLC25A24P2n/a
    
    
     
n/achr1 108,402,515SLC25A24 pseudogene 2 (from HGNC SLC25A24P2)
27ENSG00000239696n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 7,079,022ENSG00000239696 (from geneSymbol)
28ENSG00000250637n/a
    
    
     
n/achr8 43,447,907ENSG00000250637 (from geneSymbol)
29NF1P6n/a
    
    
     
n/achr22 15,627,326neurofibromin 1 pseudogene 6 (from HGNC NF1P6)
30ENSG00000226487n/a
    
    
     
n/achr1 20,412,778ENSG00000226487 (from geneSymbol)
31MTND5P8n/a
    
    
     
n/achr7 112,373,188mitochondrially encoded NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit 5 pseudogene 8 (from HGNC MTND5P8)
32NREP-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 111,964,907NREP antisense RNA 1 (from RefSeq NR_046678.1)
33ENSG00000267533n/a
    
    
     
n/achr18 12,067,795ENSG00000267533 (from geneSymbol)
34Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr17 50,386,195Y_RNA (from geneSymbol)
35DSCR4-IT1n/a
    
    
     
n/achr21 38,008,581DSCR4 intronic transcript 1 (from HGNC DSCR4-IT1)
36CAPZA1P4n/a
    
    
     
n/achr7 131,893,115CAPZA1P4 (from geneSymbol)
37ENSG00000237633n/a
    
    
     
n/achr2 16,539,377ENSG00000237633 (from geneSymbol)
38ENSG00000242536n/a
    
    
     
n/achr3 157,951,902ENSG00000242536 (from geneSymbol)
39ENSG00000258503n/a
    
    
     
n/achr14 53,012,119ENSG00000258503 (from geneSymbol)
40YWHAEP2n/a
    
    
     
n/achr17 18,418,250tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein epsilon pseudogene 2 (from HGNC YWHAEP2)
41CRIP1P4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22 24,712,406cysteine rich protein 1 pseudogene 4 (from HGNC CRIP1P4)
42ENSG00000232309n/a
    
    
     
n/achr1 182,127,989ENSG00000232309 (from geneSymbol)
43RPL13AP21n/a
    
    
     
n/achr12 46,004,361ribosomal protein L13a pseudogene 21 (from HGNC RPL13AP21)
44ENSG00000255628n/a
    
    
     
n/achr12 34,156,038ENSG00000255628 (from geneSymbol)
45ENSG00000261111n/a
    
    
     
n/achr16 32,635,859ENSG00000261111 (from geneSymbol)
46DEFB125n/a
    
    
     
n/achr20 92,383defensin beta 125 (from RefSeq NM_153325.4)
47ENSG00000234275n/a
    
    
     
n/achr2 6,300,065ENSG00000234275 (from geneSymbol)
48KRTAP5-13Pn/a
    
    
     
n/achr11 71,568,807keratin associated protein 5-13, pseudogene (from HGNC KRTAP5-13P)
49HES3n/a
    
    
     
n/achr1 6,244,878hes family bHLH transcription factor 3 (from RefSeq NM_001024598.4)
50ENSG00000224529n/a
    
    
     
n/achr2 208,136,545ENSG00000224529 (from geneSymbol)