UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ENSG00000286030n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 35,522,624ENSG00000286030 (from geneSymbol)
2TOMM20P2n/a
    
    
     
n/achr17 35,514,976TOMM20 pseudogene 2 (from HGNC TOMM20P2)
3TRGV3n/a
    
    
     
n/achr7 38,358,837V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt P03979)
4ENSG00000262151n/a
    
    
     
n/achr16 10,876,833ENSG00000262151 (from geneSymbol)
5ENSG00000269050n/a
    
    
     
n/achr19 38,871,961ENSG00000269050 (from geneSymbol)
6ENSG00000257452n/a
    
    
     
n/achr12 112,962,689ENSG00000257452 (from geneSymbol)
7UNC93B5n/a
    
    
     
n/achr11 67,713,853unc-93 homolog B5, pseudogene (from HGNC UNC93B5)
8TRGV5n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 38,349,688V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0B4J1U4)
9ENSG00000262312n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 3,544,126ENSG00000262312 (from geneSymbol)
10TRGV5Pn/a
    
    
     
n/achr7 38,345,264T cell receptor gamma variable 5P (pseudogene) (from HGNC TRGV5P)
11MIR4496n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 108,635,840microRNA 4496 (from RefSeq NR_039717.1)
12PERPP3n/a
    
    
     
n/achr6 16,161,168PERPP3 (from geneSymbol)
13XCL1n/a
    
    
     
n/achr1 168,579,337X-C motif chemokine ligand 1 (from RefSeq NM_002995.3)
14RPL17P28n/a
    
    
     
n/achr7 139,049,731ribosomal protein L17 pseudogene 28 (from HGNC RPL17P28)
15ENSG00000234211n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 161,673,401ENSG00000234211 (from geneSymbol)
16ENSG00000225931n/a
    
    
     
n/achr1 2,568,149ENSG00000225931 (from geneSymbol)
17TRGV7n/a
    
    
     
n/achr7 38,335,277T cell receptor gamma variable 7 (pseudogene) (from HGNC TRGV7)
18ENSG00000267349n/a
    
    
     
n/achr17 35,478,219ENSG00000267349 (from geneSymbol)
19LINC01150n/a
    
    
     
n/achr11 1,902,835long intergenic non-protein coding RNA 1150 (from HGNC LINC01150)
20IL9RP3n/a
    
    
     
n/achr16 33,828interleukin 9 receptor pseudogene 3 (from HGNC IL9RP3)
21ENSG00000267359n/a
    
    
     
n/achr17 35,553,986uncharacterized LOC107985033, transcript variant 2 (from RefSeq NR_138032.1)
22SIGLEC22Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 51,211,599sialic acid binding Ig like lectin 22, pseudogene (from HGNC SIGLEC22P)
23PLCB2-AS1n/a
    
    
     
n/achr15 40,301,245PLCB2 antisense RNA 1 (from HGNC PLCB2-AS1)
24RPS12P20n/a
    
    
     
n/achr11 72,708,375ribosomal protein S12 pseudogene 20 (from HGNC RPS12P20)
25RGS17P1n/a
    
    
     
n/achr13 40,993,055regulator of G protein signaling 17 pseudogene 1 (from HGNC RGS17P1)
26ENSG00000272334n/a
    
    
     
n/achr3 36,973,394ENSG00000272334 (from geneSymbol)
27CYLD-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 50,735,116CYLD antisense RNA 1, transcript variant 7 (from RefSeq NR_184279.1)
28ARID3BP1n/a
    
    
     
n/achr1 81,502,631ARID3BP1 (from geneSymbol)
29ENSG00000217078n/a
    
    
     
n/achr6 16,163,569ENSG00000217078 (from geneSymbol)
30GPR82n/a
    
    
     
n/achrX 41,727,155G protein-coupled receptor 82 (from RefSeq NM_080817.5)
31ENSG00000264739n/a
    
    
     
n/achr17 16,415,606ENSG00000264739 (from geneSymbol)
32ENSG00000272908n/a
    
    
     
n/achr7 38,327,856ENSG00000272908 (from geneSymbol)
33ERCC6Ln/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 72,221,846ERCC excision repair 6 like, spindle assembly checkpoint helicase, transcript variant 1 (from RefSeq NM_017669.4)
34FTH1P22n/a
    
    
     
n/achr1 116,775,363ferritin heavy chain 1 pseudogene 22 (from HGNC FTH1P22)
35PRADC1P1n/a
    
    
     
n/achr3 36,976,578protease associated domain containing 1 pseudogene 1 (from HGNC PRADC1P1)
36RPL32P11n/a
    
    
     
n/achr3 25,749,692ribosomal protein L32 pseudogene 11 (from HGNC RPL32P11)
37LINC03058n/a
    
    
     
n/achr14 20,784,090LINC03058 (from geneSymbol)
38ENSG00000265334n/a
    
    
     
n/achr17 30,848,676ENSG00000265334 (from geneSymbol)
39ENSG00000272211n/a
    
    
     
n/achr2 196,153,072ENSG00000272211 (from geneSymbol)
40RPS3AP18n/a
    
    
     
n/achr4 152,551,820ribosomal protein S3a pseudogene 18 (from HGNC RPS3AP18)
41HSPE1P18n/a
    
    
     
n/achr11 118,209,071heat shock protein family E (Hsp10) member 1 pseudogene 18 (from HGNC HSPE1P18)
42MIR5195n/a
    
    
     
n/achr14 106,850,942microRNA 5195 (from RefSeq NR_049827.1)
43TIGITn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 114,302,158T cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains (from RefSeq NM_173799.4)
44PSME2P1n/a
    
    
     
n/achr5 98,213,761proteasome activator subunit 2 pseudogene 1 (from HGNC PSME2P1)
45KLHDC7Bn/a
    
    
     
n/achr22 50,548,461kelch domain containing 7B (from RefSeq NM_138433.5)
46ENSG00000272839n/a
    
    
     
n/achr7 157,868,846ENSG00000272839 (from geneSymbol)
47DOCK8-AS2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 473,276DOCK8-AS2 (from geneSymbol)
48IL6-AS1n/a
    
    
     
n/achr7 22,726,507IL6 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_131935.1)
49ENSG00000228686n/a
    
    
     
n/achr1 176,018,018ENSG00000228686 (from geneSymbol)
50RN7SL535Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 143,290,762RNA, 7SL, cytoplasmic 535, pseudogene (from HGNC RN7SL535P)